147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5268 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5268  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 336 aa  650    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1212  rod shape-determining protein MreC  75.31 
 
 		 327 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  41.14 
 
 		 366 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1540  rod shape-determining protein MreC  39.69 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  37.5 
 
 		 317 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0749  rod shape-determining protein MreC  38.82 
 
 		 323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  41.95 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7284  rod shape-determining protein MreC  34.86 
 
 		 290 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3464  rod shape-determining protein MreC  36.26 
 
 		 302 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.187709  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09210  cell shape-determining protein  41.72 
 
 		 425 aa  90.9  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.76787 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  43.17 
 
 		 273 aa  89.4  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  35.09 
 
 		 248 aa  86.7  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0888455 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  34.42 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  33.83 
 
 		 273 aa  73.6  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  29.27 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  28.05 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  29.67 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  27.13 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  26.07 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  25.64 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  29.01 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 		 283 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  30.66 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  26.16 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  26.52 
 
 		 283 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  27.96 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  31.73 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  26.16 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  26.16 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  30.04 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  29.12 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  24.48 
 
 		 279 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  30.85 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  30.85 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  25.89 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  25.89 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2603  Rod shape-determining protein MreC  31.66 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  27.62 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  25.75 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  29.02 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  26.38 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  26.38 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  25.81 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  28.32 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  27.7 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  27.57 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  28.09 
 
 		 351 aa  57  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  29.92 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  24.66 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  25.81 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  28.93 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  34.23 
 
 		 274 aa  56.6  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  34.97 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  32.62 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  35.51 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  29.93 
 
 		 257 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  30.46 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  28.44 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  37.59 
 
 		 274 aa  54.3  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  32.09 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  29.46 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  28.9 
 
 		 285 aa  53.9  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  36.09 
 
 		 272 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  27.14 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  29.46 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 251 aa  53.9  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  30.29 
 
 		 283 aa  53.9  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  25.12 
 
 		 257 aa  53.9  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  27.46 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  29.46 
 
 		 333 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4600  rod shape-determining protein MreC  30.05 
 
 		 253 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  35.4 
 
 		 256 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  28.93 
 
 		 334 aa  53.1  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  29.46 
 
 		 330 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  27.14 
 
 		 348 aa  53.1  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  29.46 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  25.87 
 
 		 288 aa  52.8  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  28.25 
 
 		 346 aa  52.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  30.96 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  28.2 
 
 		 317 aa  52.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  31.07 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  24.07 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  28.95 
 
 		 310 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  31.9 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  31.46 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  25.38 
 
 		 287 aa  51.2  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  33.55 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  27.93 
 
 		 330 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  27.93 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  28.68 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  25.62 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  30.39 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  24.87 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  27.91 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  31.46 
 
 		 316 aa  50.1  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>