180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3307 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3831  rod shape-determining protein MreC  38.83 
 
 		 280 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277446  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5926  Rod shape-determining protein MreC  36.4 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  34.67 
 
 		 278 aa  149  4e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  32.68 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 		 295 aa  139  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  32.8 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  34.41 
 
 		 278 aa  132  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1395  rod shape-determining protein MreC  29.72 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0343017 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  34.16 
 
 		 276 aa  126  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  28.24 
 
 		 274 aa  99  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  31.51 
 
 		 357 aa  90.1  4e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  27.51 
 
 		 286 aa  88.6  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  23.4 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  29.85 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  29.65 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  29.21 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1166  rod shape-determining protein MreC  23.39 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  25.12 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0866  rod shape-determining protein MreC  23.32 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  24.78 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1803  rod shape-determining protein MreC  22.13 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  25.93 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  26.72 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  27.32 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  27.17 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  27.38 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  28.65 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  30.19 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  30.19 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  25.47 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  26.26 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  26.26 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  26.45 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  25.45 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  26.92 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  26.07 
 
 		 283 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  23.51 
 
 		 274 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 		 285 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  26.07 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  30.07 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  34.33 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  28.93 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  25.55 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  27.35 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  26.62 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5268  rod shape-determining protein MreC  24.23 
 
 		 336 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  24.5 
 
 		 274 aa  62  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  26.45 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  26.61 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  24.14 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  25.81 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  25.81 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  25.97 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  27.85 
 
 		 283 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  25.35 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  30.47 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  30.47 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  27.08 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  24.14 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  28.4 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  25.84 
 
 		 288 aa  58.5  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  26.45 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  23.75 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  25.81 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  26.54 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1212  rod shape-determining protein MreC  22.16 
 
 		 327 aa  57  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  24.77 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  24.77 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  24.77 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  27.95 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1403  Rod shape-determining protein MreC  25.13 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000400857  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  25.24 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  25.76 
 
 		 309 aa  55.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  24.78 
 
 		 287 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  27.21 
 
 		 359 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  27.21 
 
 		 357 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  23.47 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  28.8 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  23.18 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  28.4 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  25.97 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  24.63 
 
 		 292 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  25.97 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1190  rod shape-determining protein MreC  22.59 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.759069  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  28.4 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  27.51 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  24.46 
 
 		 251 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>