281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14230 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 302 aa  596  1e-169  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  45.56 
 
 		 292 aa  235  7e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  43.78 
 
 		 315 aa  218  8.999999999999998e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  37.18 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  36.7 
 
 		 286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  35.96 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  34.11 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  31.23 
 
 		 288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  30.86 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  35.35 
 
 		 274 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  35.57 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  31.37 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  31.93 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  33.98 
 
 		 274 aa  106  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  34.31 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  27.68 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  33.18 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  31.72 
 
 		 288 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  36.23 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  31.71 
 
 		 277 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 		 359 aa  102  8e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  28.89 
 
 		 281 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  31.02 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  28.83 
 
 		 288 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  30.6 
 
 		 263 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  32.51 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 		 311 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 		 292 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  31.55 
 
 		 286 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  29.1 
 
 		 286 aa  89.4  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  28.4 
 
 		 249 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  28.4 
 
 		 249 aa  89.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  33.68 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  28.24 
 
 		 275 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1528  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187391  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  29.72 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  30.54 
 
 		 324 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  32.02 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5268  rod shape-determining protein MreC  30.66 
 
 		 336 aa  86.7  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  26.4 
 
 		 328 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  25.17 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  30.48 
 
 		 286 aa  86.3  6e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  29.27 
 
 		 283 aa  86.3  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  31.98 
 
 		 296 aa  86.3  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  23.71 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  32.68 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  32.98 
 
 		 249 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  24.8 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  32.11 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  31.89 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  29.1 
 
 		 351 aa  83.6  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 248 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0888455 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  25.86 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7284  rod shape-determining protein MreC  26.82 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  25.37 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  25.99 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  28.99 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  30.89 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  27.96 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  30.56 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  26.95 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  25.28 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  31.68 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  30.47 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1212  rod shape-determining protein MreC  28.52 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  28.52 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  24.55 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  26.79 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  31.18 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  24.02 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  27.4 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  31.16 
 
 		 298 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 346 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  27.75 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2603  Rod shape-determining protein MreC  29.24 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  32.89 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  28.74 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  26.76 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  31.07 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  28.86 
 
 		 348 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  28.89 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  28.32 
 
 		 332 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  29.28 
 
 		 355 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  27.38 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3464  rod shape-determining protein MreC  31.5 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.187709  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  29.56 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  30.82 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  27.6 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  22.95 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  28.32 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  28.49 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  25.84 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  29.56 
 
 		 359 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>