258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2129 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 301 aa  587  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1628  rod shape-determining protein MreC  46.59 
 
 		 300 aa  246  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  40.75 
 
 		 291 aa  185  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  33.47 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  31.78 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  31.78 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  32.3 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  28.76 
 
 		 296 aa  97.1  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  33.48 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  33.48 
 
 		 302 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  29.32 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  30.59 
 
 		 254 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  32.34 
 
 		 292 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  32.87 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  35.23 
 
 		 330 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  36.99 
 
 		 292 aa  90.1  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  35.23 
 
 		 329 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  35.71 
 
 		 307 aa  90.1  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  36.42 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  35.26 
 
 		 317 aa  89  8e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  36.36 
 
 		 306 aa  89  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  35.8 
 
 		 318 aa  89.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  32.8 
 
 		 332 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  32.8 
 
 		 359 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  32.8 
 
 		 357 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  32.98 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  32.97 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  32.69 
 
 		 381 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  32.8 
 
 		 330 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  35.36 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  35.23 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  33.52 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  32.8 
 
 		 362 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  32.23 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  28.76 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  32.43 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  32.56 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  30.69 
 
 		 286 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  34.09 
 
 		 448 aa  85.9  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  32.26 
 
 		 326 aa  85.9  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  33.7 
 
 		 346 aa  85.9  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 328 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  30.83 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  29.03 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  29.13 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  35.37 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  34.76 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  31.22 
 
 		 357 aa  84  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  26.11 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  29.65 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  32.99 
 
 		 369 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  27.74 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  34.15 
 
 		 407 aa  82.4  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  32.73 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  32.48 
 
 		 355 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  32.73 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  31.64 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  27.43 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  32.73 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  27.95 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  27.98 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  32.48 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  30.85 
 
 		 298 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  33.75 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  33.75 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  32.72 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  25.21 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  30.25 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  30.38 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  32.56 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  31.9 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  28.27 
 
 		 274 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  34.97 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  32.72 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  25.19 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  33.94 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  29.64 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  31.62 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  31.62 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  33.93 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  28.02 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  32.78 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  27.02 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  25.38 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  34.34 
 
 		 285 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  33.93 
 
 		 315 aa  76.6  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  29.33 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  31.88 
 
 		 300 aa  75.5  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  27.51 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  25.42 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>