260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3646 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 311 aa  611  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  63.32 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  67.38 
 
 		 300 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  67.49 
 
 		 304 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  67.73 
 
 		 300 aa  364  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  64.86 
 
 		 310 aa  364  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  62.21 
 
 		 315 aa  345  5e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  42.8 
 
 		 317 aa  195  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  34.65 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0582  rod shape-determining protein MreC  34.92 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254357  hitchhiker  0.0000000000148886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  36.04 
 
 		 381 aa  129  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  34.41 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0656  rod shape-determining protein MreC  32.96 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0227203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  34.76 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  32.17 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  31.84 
 
 		 274 aa  97.8  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  32.5 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  34.5 
 
 		 273 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  34.05 
 
 		 274 aa  96.7  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  28.93 
 
 		 291 aa  96.3  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  30.17 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 		 286 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  30.93 
 
 		 274 aa  93.2  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  28.75 
 
 		 274 aa  92.8  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  30.83 
 
 		 281 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  29.64 
 
 		 286 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  28.95 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  34.11 
 
 		 318 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  33.89 
 
 		 362 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  31.84 
 
 		 414 aa  90.1  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  30.11 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  31.3 
 
 		 359 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  33.17 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  28.7 
 
 		 286 aa  89  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  29.18 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  32.58 
 
 		 257 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  31.9 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  30.87 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  27.85 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  32.24 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  30.8 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  33.17 
 
 		 330 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  33.47 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  31.15 
 
 		 357 aa  87  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  31.42 
 
 		 296 aa  87  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  32.84 
 
 		 326 aa  87  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  32.85 
 
 		 332 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  32.85 
 
 		 330 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  29.55 
 
 		 292 aa  86.3  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  32.76 
 
 		 299 aa  85.9  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  32.6 
 
 		 251 aa  85.9  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  31.76 
 
 		 292 aa  85.9  8e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  35.8 
 
 		 243 aa  85.9  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  32.84 
 
 		 285 aa  85.5  9e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  29.91 
 
 		 307 aa  85.9  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  31.44 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  30.9 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  30.7 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1628  rod shape-determining protein MreC  30.48 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  30.62 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  30.13 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  31.98 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  31.33 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  31.33 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  30.96 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  31.64 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  36.53 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  32.96 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  29.82 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  32.78 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  34.73 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  29.26 
 
 		 369 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  35.15 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  35.15 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  33.73 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  32.22 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  33.53 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  32.4 
 
 		 348 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  33.53 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  33.53 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  28.03 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  29.57 
 
 		 326 aa  79.7  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  28.82 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  29.18 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  37.43 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  34.65 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  33.2 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  33.2 
 
 		 338 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  32.22 
 
 		 305 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  33.2 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>