254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1490 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 381 aa  738    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  36.84 
 
 		 317 aa  179  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  38.61 
 
 		 334 aa  166  9e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  39.23 
 
 		 300 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  39.23 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  38.76 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  37.35 
 
 		 310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  33.73 
 
 		 299 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  36.04 
 
 		 311 aa  130  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  34.45 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  35.16 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  35.37 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  35.62 
 
 		 324 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  38.12 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  34.34 
 
 		 338 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  32.49 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  30.34 
 
 		 317 aa  100  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  31.76 
 
 		 359 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  31.37 
 
 		 357 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 288 aa  99  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  29.46 
 
 		 334 aa  98.6  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  34.5 
 
 		 318 aa  97.8  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  29.66 
 
 		 293 aa  97.8  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0582  rod shape-determining protein MreC  32.06 
 
 		 301 aa  97.8  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254357  hitchhiker  0.0000000000148886 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  33 
 
 		 348 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  36.25 
 
 		 274 aa  97.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  33 
 
 		 348 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  30.92 
 
 		 307 aa  96.3  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  34.35 
 
 		 329 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  34.95 
 
 		 273 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  28.86 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  27.85 
 
 		 369 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  37.04 
 
 		 274 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  36.27 
 
 		 330 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  32.86 
 
 		 281 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  27.21 
 
 		 291 aa  94.4  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  35.37 
 
 		 274 aa  94.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  30.83 
 
 		 296 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  31.15 
 
 		 299 aa  94  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  36.52 
 
 		 325 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  35.75 
 
 		 332 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  35.75 
 
 		 330 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  32 
 
 		 272 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 306 aa  92.4  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  31.14 
 
 		 331 aa  92  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  31.12 
 
 		 267 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  35.96 
 
 		 333 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  29.55 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  28.21 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  33.76 
 
 		 357 aa  91.3  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 328 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0656  rod shape-determining protein MreC  34.91 
 
 		 285 aa  90.1  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0227203  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  29.48 
 
 		 369 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 		 296 aa  89.4  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  27.86 
 
 		 309 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  30.88 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  32.46 
 
 		 346 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  27.76 
 
 		 311 aa  87.8  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  37.27 
 
 		 272 aa  87.4  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  29.39 
 
 		 298 aa  85.9  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  26.22 
 
 		 277 aa  85.9  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  34.14 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  30.73 
 
 		 306 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  30.53 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  30.53 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  32.96 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  30.53 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  32.95 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  30.53 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  26.96 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  35.64 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  29.08 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  33.5 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  26.74 
 
 		 294 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3281  rod shape-determining protein MreC  29.64 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000057378  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  30.25 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  29.13 
 
 		 285 aa  82.8  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  28.41 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3733  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0325244  normal  0.0423358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3636  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  hitchhiker  0.00366072 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  32.61 
 
 		 367 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3564  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00821336  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3565  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.145579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  30.96 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  32.4 
 
 		 311 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3671  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208863  normal  0.389982 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03109  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC  32.61 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  32.61 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3439  rod shape-determining protein MreC  32.61 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3545  rod shape-determining protein MreC  32.61 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000398804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1628  rod shape-determining protein MreC  29.62 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  29.83 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03060  hypothetical protein  32.61 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00317154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>