256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2328 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 300 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  99.67 
 
 		 300 aa  591  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  96.05 
 
 		 304 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  63 
 
 		 299 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  70.83 
 
 		 310 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  67.24 
 
 		 311 aa  371  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  70.03 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  41.92 
 
 		 317 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  37.4 
 
 		 285 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  38.79 
 
 		 381 aa  145  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  31.66 
 
 		 334 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0582  rod shape-determining protein MreC  32.28 
 
 		 301 aa  112  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254357  hitchhiker  0.0000000000148886 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  31.15 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  31.54 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0656  rod shape-determining protein MreC  35.42 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0227203  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  32.11 
 
 		 257 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  29 
 
 		 274 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  32.16 
 
 		 286 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  31.88 
 
 		 306 aa  93.2  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  29.85 
 
 		 272 aa  93.2  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  27.63 
 
 		 285 aa  92.4  8e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 		 273 aa  92.4  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  31.87 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  31.28 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  35.59 
 
 		 243 aa  89.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  32.14 
 
 		 348 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 		 283 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  29.96 
 
 		 274 aa  89  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  28.88 
 
 		 274 aa  89  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  31.34 
 
 		 300 aa  87.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  29.18 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  31.63 
 
 		 348 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  29.71 
 
 		 283 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1628  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  29.5 
 
 		 283 aa  87  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  29.24 
 
 		 274 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 283 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  28.81 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  32.29 
 
 		 357 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  32.16 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  31.39 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  33.7 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  33.15 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  27.19 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  27.19 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  31.49 
 
 		 292 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  29.21 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  31.3 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  33.15 
 
 		 332 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  33.15 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  33.15 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  28.99 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  28.99 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  29.14 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  32.16 
 
 		 251 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  29.82 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  27.52 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  32.6 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  28.99 
 
 		 283 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  36.17 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  31.77 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  26.94 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  29.61 
 
 		 309 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  33.7 
 
 		 357 aa  79.3  0.00000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  26.15 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  29.08 
 
 		 277 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  29.65 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  32.98 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  32.32 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  27.72 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  34.08 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  29.06 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  27.06 
 
 		 272 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  27.69 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  28.28 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  30.5 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  32.51 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 288 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  32.73 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  31.54 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  27.71 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  31.73 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>