250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0493 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 291 aa  559  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1628  rod shape-determining protein MreC  42.7 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  41.43 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  28.12 
 
 		 336 aa  92.8  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  32.79 
 
 		 348 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  32.79 
 
 		 348 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1282  rod shape-determining protein MreC  31.74 
 
 		 296 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  31.18 
 
 		 243 aa  89.7  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  34.17 
 
 		 310 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  28.21 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1671  rod shape-determining protein MreC  31.25 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575744 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  31.68 
 
 		 346 aa  86.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  29.83 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 324 aa  85.5  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  29.69 
 
 		 272 aa  85.5  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  31.78 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  35.56 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  31.22 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  31.47 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  27.48 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  31.45 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  35 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  31.49 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  36.81 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  25.81 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  29.23 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  32.5 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  26.64 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  30.15 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 		 362 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  28.5 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  30.46 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  30.58 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  32.24 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  31.34 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  31.61 
 
 		 357 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  32.24 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  28.92 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  33.53 
 
 		 328 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  31.78 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  29.56 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  29.56 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  29.56 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  28.9 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  29.5 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  31.02 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  32.58 
 
 		 325 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  28.79 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  32.35 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  32.35 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  27.98 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  31.18 
 
 		 311 aa  74.3  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  35.8 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  33.85 
 
 		 407 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  31.49 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  29.9 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  28.71 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  31.9 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  27.91 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18131  rod shape-determining protein MreC  29.28 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  32.67 
 
 		 448 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  27.72 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  26.73 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  31.67 
 
 		 369 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  31.74 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  29.64 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  29.59 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  24.12 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  27.62 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  28.23 
 
 		 367 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  31.89 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  29.61 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  26.7 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  29.51 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  23.53 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  29.8 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  27.9 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  28.77 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  25.75 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  25.22 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  25.22 
 
 		 283 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  28.5 
 
 		 285 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  29.3 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  34.97 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  31.02 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  29.9 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  30.73 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  30.07 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4410  rod shape-determining protein MreC  28.79 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000283267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  28.26 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  27.32 
 
 		 356 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  27.32 
 
 		 356 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>