211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1671 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1671  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 296 aa  579  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1282  rod shape-determining protein MreC  80.41 
 
 		 296 aa  431  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1190  rod shape-determining protein MreC  46.97 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.759069  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4776  rod shape-determining protein MreC  31.49 
 
 		 296 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.17516  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  27.34 
 
 		 286 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  25.55 
 
 		 275 aa  93.2  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  34.11 
 
 		 274 aa  92.8  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  31.73 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  27.84 
 
 		 277 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  26.91 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  26.92 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  32.69 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  25.45 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  28.17 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  27.5 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  26.02 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  23.48 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  25.99 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  26.62 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  24.73 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1628  rod shape-determining protein MreC  27.45 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  25.51 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  26.71 
 
 		 330 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  25.18 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  28.33 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  35.06 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  27.05 
 
 		 357 aa  70.5  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  28.15 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  24.41 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  24.91 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  25.44 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  26.22 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  27.83 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  27.53 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  24.58 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  27.53 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  27.53 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  27.86 
 
 		 359 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1540  rod shape-determining protein MreC  32.89 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.211291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  21.2 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  27.3 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  26.74 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  25.89 
 
 		 332 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  26.76 
 
 		 357 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  32.76 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  32 
 
 		 358 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  32 
 
 		 358 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  32 
 
 		 358 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  27.69 
 
 		 333 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  27.69 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  32 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 325 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  20.85 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  32.75 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  22.71 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  31.94 
 
 		 248 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0888455 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  25.09 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  24.74 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  32.76 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  24.63 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  22.37 
 
 		 279 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  29.71 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  29.71 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  29.71 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  29.71 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  29.71 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  29.71 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  29.71 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  26.22 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  22.86 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  30.51 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  28.33 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  24.73 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  29.71 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  21.91 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  21.91 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  23.55 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  24.01 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  25.62 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  28 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  27.34 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  27.01 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  28.04 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  21.77 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  29.18 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>