230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1190 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1190  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 302 aa  590  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.759069  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1671  rod shape-determining protein MreC  47.47 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1282  rod shape-determining protein MreC  46.25 
 
 		 296 aa  214  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4776  rod shape-determining protein MreC  39.06 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.17516  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  27.81 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  30.56 
 
 		 276 aa  89  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  30.84 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  24.55 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  29.01 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  25.62 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  27.89 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  29.5 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  29.14 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  24.91 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  26.79 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  27.05 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  32.12 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  23.83 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  24.91 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  23.35 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  25.38 
 
 		 251 aa  65.9  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  27.37 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  26.85 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  25.34 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  27.03 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  27.37 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  24.29 
 
 		 286 aa  63.9  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  25.62 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  30.66 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  28.99 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  29.03 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  24.07 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  30.34 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0888455 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  17.92 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  29.82 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  26.54 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  26.79 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  26.79 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  18.79 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  26.79 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  28.32 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  28.11 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  26.3 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  23.53 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  25.09 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  22.02 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  28.26 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  23.83 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  28.52 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  23.83 
 
 		 280 aa  59.7  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  30.36 
 
 		 336 aa  59.3  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  27.19 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  33.78 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  25.82 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  29.67 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  25.95 
 
 		 276 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  25.21 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  27.48 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  27.54 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 366 aa  57.4  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  27.45 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  29.07 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  29.46 
 
 		 324 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  24.3 
 
 		 288 aa  57  0.0000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  24.03 
 
 		 359 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  27.92 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 		 353 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 		 353 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 		 353 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  29.7 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  27.92 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  31.09 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  23.93 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  25.64 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  23.85 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  24.43 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  26.57 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 		 367 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  24.44 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0264  rod shape-determining protein MreC  28.4 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.032676  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  26.88 
 
 		 265 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  27.06 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  26.42 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  22.59 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  27.51 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4410  rod shape-determining protein MreC  26.48 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000283267  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>