214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1380 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1380  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
276 aa  550  1e-156  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  27.61 
 
 
271 aa  99  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  28.76 
 
 
274 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  29.9 
 
 
274 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  24.15 
 
 
281 aa  89  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  28.78 
 
 
274 aa  85.5  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  27.44 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  30.66 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  32.52 
 
 
285 aa  79  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  31.31 
 
 
315 aa  79  0.00000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  30.41 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  29.73 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  27.75 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  31.84 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  27.39 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  27.54 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 
359 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  24.89 
 
 
287 aa  71.6  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  25.09 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  26.38 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  28.67 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  30.54 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  26.75 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  27.52 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  28.97 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  22.89 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  24.05 
 
 
304 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  29.51 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  28.49 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  28.44 
 
 
448 aa  67  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  29.63 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  29.6 
 
 
274 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  26.74 
 
 
287 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1528  rod shape-determining protein MreC  26.48 
 
 
306 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.187391  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  25.33 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 
267 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  30.35 
 
 
250 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  28.49 
 
 
306 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  28 
 
 
286 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  21.25 
 
 
326 aa  63.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  24.35 
 
 
285 aa  62.8  0.000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  23.51 
 
 
286 aa  62.4  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  24.48 
 
 
328 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  30.37 
 
 
407 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  27.42 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  25.55 
 
 
318 aa  60.8  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  21.54 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  27.04 
 
 
369 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  24.18 
 
 
282 aa  60.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  28.21 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  27.17 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 
362 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  28.48 
 
 
306 aa  60.1  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  24.08 
 
 
305 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  31.41 
 
 
357 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  25.32 
 
 
283 aa  59.7  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  31.41 
 
 
359 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
249 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  26.92 
 
 
338 aa  59.3  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  26.09 
 
 
283 aa  59.3  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0852  rod shape-determining protein MreC  32.14 
 
 
248 aa  59.3  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0888455 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  24.28 
 
 
336 aa  58.9  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  26.06 
 
 
329 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  25.21 
 
 
348 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  24.89 
 
 
286 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  26.06 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1190  rod shape-determining protein MreC  28.78 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.759069  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  23.67 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  25.63 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  20.94 
 
 
311 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  25.87 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  20.87 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  28.36 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  28.36 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  25.17 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  21.58 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  21.3 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1671  rod shape-determining protein MreC  24.26 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00575744 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  23.6 
 
 
369 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  28.21 
 
 
256 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  31.41 
 
 
325 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  25.42 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  22.6 
 
 
311 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  25.17 
 
 
291 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  24.65 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 
332 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  24.63 
 
 
293 aa  56.6  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  24.55 
 
 
346 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  24.37 
 
 
348 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 
330 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 
333 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  32.17 
 
 
283 aa  55.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  32.17 
 
 
283 aa  55.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>