260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1714 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 250 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  87.55 
 
 		 249 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18131  rod shape-determining protein MreC  83.53 
 
 		 249 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570389  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  71.89 
 
 		 249 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  46.69 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  48.46 
 
 		 251 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  48.02 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  45.71 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  43.59 
 
 		 247 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  41.25 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  36.92 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  35.02 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  34.44 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  34.26 
 
 		 257 aa  132  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  29.48 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  28.86 
 
 		 265 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  32.05 
 
 		 273 aa  91.3  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  34.41 
 
 		 275 aa  88.6  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  31.87 
 
 		 274 aa  85.9  6e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  33.52 
 
 		 286 aa  82.8  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  34.46 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  28.4 
 
 		 326 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  29.07 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  29.79 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  31.74 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  36.14 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  32.02 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  29.17 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  29.59 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  34.75 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  28.05 
 
 		 274 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  31.65 
 
 		 348 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  31.65 
 
 		 348 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  29.25 
 
 		 288 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  26.95 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  28.86 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 		 311 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  28.87 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  31.05 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  29.09 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  31.54 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  29.76 
 
 		 288 aa  72.4  0.000000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  27.66 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  26.8 
 
 		 324 aa  72  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  30.6 
 
 		 286 aa  72  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  25.73 
 
 		 307 aa  72  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  28.83 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  28.83 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  32.7 
 
 		 286 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  29.14 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  30.2 
 
 		 357 aa  71.2  0.00000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  32.47 
 
 		 359 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  29.13 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  32.47 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  29.68 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  30.37 
 
 		 292 aa  70.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  29.89 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  31.21 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  29.13 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  27.1 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  29.13 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  29.68 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  29.75 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  27.45 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 		 333 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  28.49 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  30.35 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  27.67 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  27.67 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  32.21 
 
 		 284 aa  68.6  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  28.88 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  26.9 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1209  Rod shape-determining protein MreC  27.93 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0276789  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  27.52 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  29.93 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  29.09 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  30.34 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  33.76 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  27.09 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  30.25 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  28.87 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 		 414 aa  66.2  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  31.07 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>