213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0839 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
284 aa  546  1e-154  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1570  rod shape-determining protein MreC  31.97 
 
 
292 aa  133  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  32.41 
 
 
275 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  30.61 
 
 
285 aa  80.1  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  26.78 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  32.94 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  25.93 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  26.86 
 
 
285 aa  75.5  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  25.96 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  22.92 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  26.37 
 
 
274 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  22.27 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  26.48 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  28.28 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  26.15 
 
 
348 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  23.39 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  28.81 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  28.46 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  26.51 
 
 
277 aa  70.1  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  22.08 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  30.41 
 
 
324 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  26.9 
 
 
274 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  27.44 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  23.94 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  32.21 
 
 
250 aa  68.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  23.94 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  26.14 
 
 
281 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 
317 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 
249 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  28.41 
 
 
357 aa  67  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  25.33 
 
 
282 aa  67  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  25.73 
 
 
317 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  28.26 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  27.15 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  31.34 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  24.05 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  24.17 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  27.52 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  22.87 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  26.88 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  23.55 
 
 
304 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  30.48 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  24.86 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  27.22 
 
 
326 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  31.72 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  30.41 
 
 
336 aa  63.9  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  25.75 
 
 
286 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  23.96 
 
 
277 aa  62.4  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  23.01 
 
 
306 aa  62.4  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  25.42 
 
 
359 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  29.31 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  30.72 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  24.89 
 
 
367 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  22.69 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  27.03 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  27.61 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  27.71 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  27.71 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  29.05 
 
 
272 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  30.07 
 
 
251 aa  60.1  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  27.54 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  27.07 
 
 
285 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  22.73 
 
 
292 aa  59.7  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  24.05 
 
 
359 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
274 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  20.87 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  25.41 
 
 
274 aa  59.7  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  22.69 
 
 
355 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  27.82 
 
 
283 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  28.89 
 
 
286 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  25.1 
 
 
283 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  29.94 
 
 
291 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  24.05 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  27.91 
 
 
271 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  24.89 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  24.05 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  29.94 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  22.69 
 
 
367 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  24.75 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  24.05 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  22.32 
 
 
281 aa  58.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  24.05 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  24.05 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  24.05 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  24.05 
 
 
357 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  22.13 
 
 
356 aa  58.5  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  23.39 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  27.38 
 
 
369 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  22.27 
 
 
358 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  22.27 
 
 
358 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  22.27 
 
 
358 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  21.9 
 
 
272 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  21.85 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  25.32 
 
 
296 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  26.88 
 
 
247 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>