266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0574 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
285 aa  569  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  53.05 
 
 
285 aa  302  4.0000000000000003e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  43.77 
 
 
283 aa  266  4e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  40.45 
 
 
283 aa  196  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  34.53 
 
 
285 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  38.13 
 
 
291 aa  182  7e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  33.81 
 
 
283 aa  175  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 
283 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 
283 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 
288 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  32.73 
 
 
283 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 
283 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  32.01 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  34.05 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  32.73 
 
 
283 aa  165  9e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  32.01 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
283 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  30.99 
 
 
288 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  32.37 
 
 
279 aa  149  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  31.65 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  31.65 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  31.76 
 
 
276 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  32.38 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  28.87 
 
 
288 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  33.19 
 
 
272 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  30.17 
 
 
275 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  26.04 
 
 
277 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  28 
 
 
273 aa  102  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  29.26 
 
 
274 aa  101  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 
255 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  28.97 
 
 
286 aa  99.4  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
277 aa  98.2  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0040  rod shape-determining protein MreC  31.05 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  27.76 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 
288 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 
253 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 
273 aa  95.5  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  27.2 
 
 
286 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  30.29 
 
 
274 aa  94.4  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  28.06 
 
 
304 aa  93.6  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  31.86 
 
 
357 aa  93.6  4e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  24.81 
 
 
274 aa  92  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  27.32 
 
 
274 aa  90.1  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  27.1 
 
 
271 aa  89.7  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  30.69 
 
 
291 aa  89.4  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  26.45 
 
 
281 aa  89  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  28.03 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  25.26 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  28.71 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  26.75 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  28.19 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  24.91 
 
 
299 aa  86.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  25.09 
 
 
296 aa  85.9  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  26.72 
 
 
286 aa  86.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  25.27 
 
 
296 aa  85.9  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  27.12 
 
 
309 aa  85.5  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  28.42 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  30.65 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  28.02 
 
 
274 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  25.55 
 
 
277 aa  82.4  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  27.4 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  25.96 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  25.95 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 
336 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0839  Rod shape-determining protein MreC  30.61 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  27.51 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  30.56 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  27.07 
 
 
300 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  27.07 
 
 
300 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  26.07 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  27.19 
 
 
356 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  27.71 
 
 
310 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  26.62 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2603  Rod shape-determining protein MreC  27.49 
 
 
263 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  27.01 
 
 
286 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  25.45 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  30.29 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  26.64 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  28 
 
 
338 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  24.3 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  26.7 
 
 
312 aa  75.5  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 
288 aa  75.1  0.000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  30.15 
 
 
329 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  25.93 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  25.53 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  30.15 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  27.21 
 
 
414 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  26.53 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  25.74 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  26.53 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  25.26 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  25.75 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  26.84 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  28.33 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  29.07 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  28.07 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>