250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_17471 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_17471  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
247 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01801  rod shape-determining protein MreC  57.79 
 
 
247 aa  284  9e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.989996 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  53.88 
 
 
248 aa  260  1e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  53.28 
 
 
251 aa  260  1e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  52.05 
 
 
251 aa  257  9e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  51.84 
 
 
248 aa  250  1e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  46.75 
 
 
249 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  46.69 
 
 
250 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18101  rod shape-determining protein MreC  45.45 
 
 
249 aa  228  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.448096  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18131  rod shape-determining protein MreC  46.28 
 
 
249 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.570389  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  37.92 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  35.34 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  38.21 
 
 
257 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  33.89 
 
 
249 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  33.89 
 
 
249 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  33.06 
 
 
273 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  35.15 
 
 
265 aa  130  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  34.98 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  36.17 
 
 
285 aa  86.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1209  Rod shape-determining protein MreC  32.04 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0276789  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  32.43 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  29.56 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  32.59 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  30.63 
 
 
272 aa  79.3  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  31.72 
 
 
357 aa  79  0.00000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  28.44 
 
 
329 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  28.44 
 
 
330 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  33.58 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  30.57 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  27.97 
 
 
277 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  30.32 
 
 
317 aa  75.1  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  36.03 
 
 
274 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  32.21 
 
 
267 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  28.77 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  34.29 
 
 
274 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  30.45 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  28.89 
 
 
362 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  35 
 
 
282 aa  72.8  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0174  rod shape-determining protein MreC  29.76 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  33.57 
 
 
292 aa  72.4  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  28.44 
 
 
318 aa  72  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  28.89 
 
 
325 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  29.45 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  28.44 
 
 
333 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  28.44 
 
 
332 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  31.21 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  31.79 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  31.21 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  28.44 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  33.55 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  28.63 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  28.38 
 
 
359 aa  69.7  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  29.73 
 
 
292 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  31.76 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  31.76 
 
 
357 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  28.9 
 
 
299 aa  68.9  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  28.05 
 
 
316 aa  68.6  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  28.05 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  28.32 
 
 
288 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  30.96 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  29.38 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  30.49 
 
 
306 aa  67  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  29.34 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0503  rod shape-determining protein MreC  27.33 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00353407 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  30.41 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
311 aa  66.2  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  28.44 
 
 
328 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  29.2 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  27.91 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  25.22 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  28.49 
 
 
286 aa  65.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  28.65 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 
291 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  26.55 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  27.18 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  28.48 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  31.03 
 
 
381 aa  64.7  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 
288 aa  64.7  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  27.89 
 
 
296 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 
315 aa  63.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1628  rod shape-determining protein MreC  28.65 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  26.99 
 
 
296 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  26.55 
 
 
309 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  28.07 
 
 
243 aa  63.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  30.34 
 
 
306 aa  62.8  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  27.81 
 
 
283 aa  62.4  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1190  rod shape-determining protein MreC  28.38 
 
 
302 aa  62.4  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.759069  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  26.7 
 
 
304 aa  62  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0082  rod shape-determining protein MreC  27.87 
 
 
311 aa  62  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.147193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  27.56 
 
 
300 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1403  Rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000400857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  29.86 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  27.89 
 
 
271 aa  61.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  26.46 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  28.12 
 
 
334 aa  61.2  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>