227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0582 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0582  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 301 aa  593  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.254357  hitchhiker  0.0000000000148886 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0656  rod shape-determining protein MreC  43.91 
 
 		 285 aa  208  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0227203  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  41.46 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  35.38 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3646  rod shape-determining protein MreC  36.12 
 
 		 311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.178168 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  35.59 
 
 		 310 aa  128  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0472  rod shape-determining protein MreC  33.46 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1002  rod shape-determining protein MreC  32.22 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.335478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2328  rod shape-determining protein MreC  33.04 
 
 		 300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.301217  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1601  rod shape-determining protein MreC  32.6 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  30.16 
 
 		 299 aa  112  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2016  rod shape-determining protein MreC  34.75 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.149898  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  33.62 
 
 		 381 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  27.82 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  26.77 
 
 		 277 aa  86.3  6e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  27.1 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  28.81 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  28.81 
 
 		 329 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  27.16 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  29 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  27.92 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 358 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 358 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 358 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  27.92 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 356 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  30.67 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  27.6 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  28.26 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 333 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2373  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.729262  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  27.94 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  29.46 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1413  rod shape-determining protein MreC  30.61 
 
 		 307 aa  69.7  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0196901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  27.72 
 
 		 362 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0145  rod shape-determining protein MreC  27.71 
 
 		 359 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.811267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  28.25 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0295  rod shape-determining protein MreC  27.06 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  29.02 
 
 		 267 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  26.41 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  26.58 
 
 		 336 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  26.07 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  32.39 
 
 		 281 aa  66.2  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  28.98 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  28.86 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  34.23 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1460  rod shape-determining protein MreC  27.05 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000590087  hitchhiker  0.00000334343 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  26.57 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0234  rod shape-determining protein MreC  30.3 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.236094  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  27.05 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  31.43 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  22.82 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  27.96 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  28.3 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0240  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.857372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  27.55 
 
 		 338 aa  62.4  0.000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  23.27 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  30.6 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  22.36 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0284  rod shape-determining protein MreC  26.09 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0223  rod shape-determining protein MreC  25.99 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  21.92 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  28.81 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  26.96 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  33.55 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  28.02 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  29.2 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  20.14 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0493  rod shape-determining protein MreC  29.85 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.112191  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  33.51 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  26.09 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  26.09 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  27.23 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  24.73 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  22.63 
 
 		 286 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  24.14 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  22.54 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  24.14 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  33.55 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  30.58 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  24.14 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  33.55 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1628  rod shape-determining protein MreC  29.19 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>