223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2603 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2603  Rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
263 aa  506  9.999999999999999e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  67.36 
 
 
263 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  33.59 
 
 
304 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  36.76 
 
 
272 aa  96.3  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  26.34 
 
 
286 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  28.99 
 
 
288 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  33.19 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  26.12 
 
 
277 aa  89  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  33.48 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  31.16 
 
 
357 aa  87.8  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  28.68 
 
 
271 aa  86.7  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  33.17 
 
 
274 aa  86.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  30.21 
 
 
317 aa  86.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  27.6 
 
 
286 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  27.57 
 
 
302 aa  82  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  28.75 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  25.65 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  29.69 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  29.69 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  32.31 
 
 
277 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  28.87 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  27.49 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  33.66 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  33 
 
 
359 aa  79.7  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  29.48 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  27.41 
 
 
288 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  26.22 
 
 
286 aa  77  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  31.53 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  32.31 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 
285 aa  76.3  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  27.86 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  28.83 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  28.89 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  33.17 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  22.22 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  28.51 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  30.7 
 
 
362 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  33.84 
 
 
273 aa  72.4  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  30.73 
 
 
359 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  30.5 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  21.84 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  31.96 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  26.99 
 
 
288 aa  70.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  31.44 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  27.72 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 
332 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 
330 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5268  rod shape-determining protein MreC  31.66 
 
 
336 aa  69.3  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  35.83 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  26.09 
 
 
282 aa  68.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  30.26 
 
 
325 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  32.42 
 
 
316 aa  68.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  31.17 
 
 
338 aa  67.4  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  29.67 
 
 
348 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  25.74 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  26.57 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0150  rod shape-determining protein MreC  32.5 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  26.57 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  32.2 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  32.76 
 
 
448 aa  66.6  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  25.48 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  28.03 
 
 
317 aa  65.9  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  29.23 
 
 
315 aa  65.9  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0594  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  27.04 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  25.65 
 
 
287 aa  65.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0060  rod shape-determining protein MreC  31.58 
 
 
346 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.24193  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  26.94 
 
 
283 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  25.82 
 
 
283 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  28.03 
 
 
356 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  28.03 
 
 
356 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  31.46 
 
 
348 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  30 
 
 
324 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  24.45 
 
 
283 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  26.28 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  27.85 
 
 
369 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  28.15 
 
 
367 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  29.69 
 
 
274 aa  63.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  27.47 
 
 
292 aa  63.2  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 
367 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  27.39 
 
 
355 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  26.58 
 
 
369 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4033  rod shape-determining protein MreC  28.28 
 
 
310 aa  62.4  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.245 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  30.69 
 
 
304 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  29.05 
 
 
358 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  29.05 
 
 
358 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  29.05 
 
 
358 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  33.33 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  31.44 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  28.78 
 
 
300 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 
357 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 
357 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  26.72 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0169  rod shape-determining protein MreC  27 
 
 
357 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0867  rod shape-determining protein MreC  30.58 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000732339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>