201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0573 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
266 aa  541  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  46.92 
 
 
286 aa  255  5e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0866  rod shape-determining protein MreC  46.46 
 
 
280 aa  237  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  46.03 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1166  rod shape-determining protein MreC  40.32 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  42.73 
 
 
276 aa  207  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1803  rod shape-determining protein MreC  35.11 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  31.51 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5926  Rod shape-determining protein MreC  32.85 
 
 
278 aa  105  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1395  rod shape-determining protein MreC  30.64 
 
 
295 aa  97.4  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0343017 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3831  rod shape-determining protein MreC  27.97 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277446  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  30.23 
 
 
278 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  30.4 
 
 
286 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  28.25 
 
 
295 aa  89.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  23.33 
 
 
276 aa  89.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  37.04 
 
 
283 aa  86.3  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  26.82 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  24.45 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  28.63 
 
 
257 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  26.89 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  28.22 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  28.1 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  28.7 
 
 
317 aa  80.5  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  32.52 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  25.37 
 
 
272 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  30.43 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  29.33 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  28.85 
 
 
273 aa  75.5  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  24.78 
 
 
279 aa  75.5  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  24.89 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  24.89 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  32.03 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  23.36 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  29.27 
 
 
281 aa  72  0.000000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  27.57 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  31.65 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  29.77 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  31.4 
 
 
272 aa  68.9  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  25.62 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  25.38 
 
 
306 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  30.94 
 
 
299 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  27.43 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 
288 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  31.88 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  30.49 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  26 
 
 
304 aa  65.9  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  33.61 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  27.67 
 
 
317 aa  65.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  29.08 
 
 
407 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2500  rod shape-determining protein MreC  28.22 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1355  rod shape-determining protein MreC  28.22 
 
 
291 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 
316 aa  63.5  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0749  rod shape-determining protein MreC  37.09 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302394  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1452  rod shape-determining protein MreC  27.8 
 
 
291 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  27.74 
 
 
285 aa  63.2  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 
283 aa  63.2  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  29.24 
 
 
263 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  25.12 
 
 
274 aa  62.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
283 aa  62.4  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7284  rod shape-determining protein MreC  29.57 
 
 
290 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  30.52 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  26.79 
 
 
287 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  26.91 
 
 
285 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0484  rod shape-determining protein MreC  23.35 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0223264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  26.78 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
283 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  27.47 
 
 
274 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  23.87 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  29.87 
 
 
283 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  25.1 
 
 
351 aa  60.1  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 
366 aa  60.1  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  28.06 
 
 
448 aa  59.7  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 
271 aa  59.7  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  30.21 
 
 
317 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  31.16 
 
 
298 aa  59.3  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
283 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  22.84 
 
 
286 aa  58.9  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3464  rod shape-determining protein MreC  28.08 
 
 
302 aa  58.9  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.187709  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  28.21 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 
300 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  27.97 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  28.12 
 
 
288 aa  57  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  23.39 
 
 
285 aa  57  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 
283 aa  56.6  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  26.01 
 
 
249 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0163  rod shape-determining protein MreC  29 
 
 
296 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  23.44 
 
 
357 aa  56.6  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  26.01 
 
 
249 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  27.92 
 
 
283 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  27.92 
 
 
283 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2821  rod shape-determining protein MreC  26.55 
 
 
319 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  23.76 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  26.52 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  25.49 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1151  rod shape-determining protein MreC  31.15 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.692964  hitchhiker  0.00596103 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  24.74 
 
 
292 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>