216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1317 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1317  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 297 aa  589  1e-167  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0592341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  28.99 
 
 		 277 aa  93.2  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  25.54 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  25.91 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  29.15 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  27.38 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  27.1 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  25.47 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  28.43 
 
 		 271 aa  74.3  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  23.77 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  26.57 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  23.08 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  24.74 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  26.2 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0355  rod shape-determining protein MreC  23.51 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  24.74 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  26.51 
 
 		 283 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  24.38 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  29.29 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  28.64 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  25.94 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  25.45 
 
 		 333 aa  68.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  28.97 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  22.66 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  26.09 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  24.52 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  26.47 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  24.64 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  26.89 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  23.72 
 
 		 317 aa  67  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  27.91 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  27.91 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2022  rod shape-determining protein MreC  24.48 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.102546  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  25.24 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4600  rod shape-determining protein MreC  28.87 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3922  rod shape-determining protein MreC  24.23 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  28.14 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  28.06 
 
 		 292 aa  65.9  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  22.71 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  24.7 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  22.71 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  25.56 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0421  rod shape-determining protein MreC  23 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00423645  hitchhiker  0.000135792 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  27.78 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  26.6 
 
 		 282 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  27.14 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  23.86 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  22.26 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  23.59 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  24 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1739  rod shape-determining protein MreC  24.64 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  28.28 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  28.87 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  28.87 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2193  rod shape-determining protein MreC  23.97 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.158652  hitchhiker  0.0000258369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  28.87 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2563  rod shape-determining protein MreC  23.97 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.59915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  23.59 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  26.17 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  26.88 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  25.38 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  26.16 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  26.16 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  26.46 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  27.36 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  25.42 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  26.55 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  24.79 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  24.56 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  29.55 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  25.64 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0106  rod shape-determining protein MreC  24.02 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.73351 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  27.14 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  24.54 
 
 		 357 aa  58.9  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  20.89 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  24.64 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  25.25 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0261  rod shape-determining protein MreC  23.67 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  25.28 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  28.65 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  22.9 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  29.05 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  29.68 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  23.1 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  21.74 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2129  rod shape-determining protein MreC  25.15 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  29.37 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  26.87 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1164  Rod shape-determining protein MreC  22.12 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24115  normal  0.328813 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  24.75 
 
 		 285 aa  55.8  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  24.72 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  28.71 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  23.31 
 
 		 328 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>