146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0866 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0866  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 280 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1166  rod shape-determining protein MreC  61.17 
 
 		 283 aa  363  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  59.35 
 
 		 286 aa  348  4e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  51.07 
 
 		 280 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0711  rod shape-determining protein MreC  44.57 
 
 		 276 aa  250  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1803  rod shape-determining protein MreC  43.93 
 
 		 285 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  46.46 
 
 		 266 aa  237  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  28.05 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0807  rod shape-determining protein MreC  32.08 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1395  rod shape-determining protein MreC  29.14 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0343017 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1509  hypothetical protein  30.57 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  30.48 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3831  rod shape-determining protein MreC  32 
 
 		 280 aa  87  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277446  normal  0.172349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  24.68 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1875  rod shape-determining protein MreC  27.24 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.813624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  26.15 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0193  rod shape-determining protein MreC  26.98 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  28.82 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5926  Rod shape-determining protein MreC  27.31 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  29.3 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  29.44 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2374  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.879579  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3307  rod shape-determining protein MreC  23.32 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.198941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  25.38 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  25.38 
 
 		 283 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  26.84 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  26.24 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  25.46 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  25.35 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  25.87 
 
 		 272 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  28.65 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  26.43 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  27.16 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  29.11 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  25.23 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  25 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  27.04 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  28.21 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  27.27 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  27.37 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  28.72 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  25.82 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  27.1 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  26.7 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  28.76 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  28.02 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  23.6 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  26.05 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5931  rod shape-determining protein MreC  28.24 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0609837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  27.85 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2467  rod shape-determining protein MreC  31.16 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 		 283 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  24.26 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  26.75 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  28.57 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  24.26 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  25.14 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  25.37 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  30.33 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  25.49 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1490  rod shape-determining protein MreC  26.67 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.116968 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  24.32 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  25.5 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  25.54 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  28.87 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  26.63 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  29.5 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0299  rod shape-determining protein MreC  28.77 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  24.09 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  23.31 
 
 		 357 aa  54.3  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3387  Rod shape-determining protein MreC  29.25 
 
 		 298 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.165741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2480  rod shape-determining protein MreC  25.71 
 
 		 317 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174649  normal  0.303717 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  26.72 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  24.88 
 
 		 296 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  24.44 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1631  rod shape-determining protein MreC  25.73 
 
 		 282 aa  53.5  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.017053  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4600  rod shape-determining protein MreC  25.37 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  25.82 
 
 		 285 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  27.74 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  27.74 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  25.3 
 
 		 333 aa  52.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  27.42 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1317  rod shape-determining protein MreC  26.22 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0592341  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  24.55 
 
 		 286 aa  50.8  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0749  rod shape-determining protein MreC  34.46 
 
 		 323 aa  50.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  25.11 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  25.44 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1198  rod shape-determining protein MreC  28.68 
 
 		 251 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7281  Cell shape-determining protein-like protein  25.34 
 
 		 317 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.205543 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09210  cell shape-determining protein  43.94 
 
 		 425 aa  50.1  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.76787 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  22.02 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  23.5 
 
 		 274 aa  49.7  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20731  rod shape-determining protein MreC  29.23 
 
 		 251 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>