268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0253 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0253  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 		 327 aa  660    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00109654  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0264  rod shape-determining protein MreC  96.02 
 
 		 327 aa  565  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.032676  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3676  rod shape-determining protein MreC  83.91 
 
 		 414 aa  551  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00252425  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3834  rod shape-determining protein MreC  85.62 
 
 		 383 aa  521  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0283563  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4410  rod shape-determining protein MreC  82.98 
 
 		 334 aa  502  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000283267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1197  rod shape-determining protein MreC  82.41 
 
 		 331 aa  500  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000315493  hitchhiker  0.00816148 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0399  rod shape-determining protein MreC  82.41 
 
 		 331 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.216027  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0466  rod shape-determining protein MreC  82.41 
 
 		 331 aa  500  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0018954  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3671  rod shape-determining protein MreC  81.04 
 
 		 350 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208863  normal  0.389982 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3733  rod shape-determining protein MreC  81.04 
 
 		 350 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0325244  normal  0.0423358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3564  rod shape-determining protein MreC  81.04 
 
 		 350 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00821336  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3565  rod shape-determining protein MreC  81.04 
 
 		 350 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.145579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3636  rod shape-determining protein MreC  81.04 
 
 		 350 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0150726  hitchhiker  0.00366072 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3281  rod shape-determining protein MreC  80.31 
 
 		 361 aa  484  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000057378  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03109  cell wall structural complex MreBCD transmembrane component MreC  80.31 
 
 		 367 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0024282  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0457  rod shape-determining protein MreC  80.31 
 
 		 367 aa  483  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000354374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3545  rod shape-determining protein MreC  80.31 
 
 		 367 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000398804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03060  hypothetical protein  80.31 
 
 		 367 aa  483  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00317154  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4566  rod shape-determining protein MreC  80.31 
 
 		 367 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000293229  normal  0.735878 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3733  rod shape-determining protein MreC  80.31 
 
 		 367 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011451  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3439  rod shape-determining protein MreC  80.31 
 
 		 367 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000626675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0457  rod shape-determining protein MreC  80 
 
 		 367 aa  480  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00301189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3686  rod shape-determining protein MreC  81.17 
 
 		 338 aa  472  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000135967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0048  rod shape-determining protein MreC  57.47 
 
 		 288 aa  311  1e-83  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  50.85 
 
 		 351 aa  310  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  52.86 
 
 		 299 aa  307  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  52.86 
 
 		 296 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0484  rod shape-determining protein MreC  54.21 
 
 		 285 aa  301  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0116086  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  51.5 
 
 		 296 aa  300  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0468  rod shape-determining protein MreC  48.89 
 
 		 309 aa  269  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077697  normal  0.642042 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0404  rod shape-determining protein MreC  48.23 
 
 		 293 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00230654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0575  rod shape-determining protein MreC  48.23 
 
 		 334 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000194769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  44.61 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4097  rod shape-determining protein MreC  50.55 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1123  rod shape-determining protein MreC  48.03 
 
 		 326 aa  249  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3647  rod shape-determining protein MreC  50.18 
 
 		 353 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0178406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3471  rod shape-determining protein MreC  50.18 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0021778  normal  0.815632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0480  rod shape-determining protein MreC  50.18 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.589731  normal  0.326651 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4401  rod shape-determining protein MreC  49.82 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00873954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0559  rod shape-determining protein MreC  46.67 
 
 		 298 aa  246  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0551516  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3753  rod shape-determining protein MreC  46.71 
 
 		 295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000670381  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0498  rod shape-determining protein MreC  49.08 
 
 		 336 aa  242  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0519  rod shape-determining protein MreC  49.08 
 
 		 336 aa  242  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000295389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3821  rod shape-determining protein MreC  49.08 
 
 		 338 aa  241  9e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00205381  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0523  rod shape-determining protein MreC  49.08 
 
 		 336 aa  241  9e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0013052  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0184  rod shape-determining protein MreC  46.3 
 
 		 286 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00341566  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3737  rod shape-determining protein MreC  47.41 
 
 		 320 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00218266  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3333  rod shape-determining protein MreC  44.44 
 
 		 294 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0190345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0857  rod shape-determining protein MreC  39.32 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00265  rod shape-determining protein MreC  47.04 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0246577  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12660  rod shape-determining protein MreC  40.31 
 
 		 318 aa  218  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  41.85 
 
 		 317 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4162  rod shape-determining protein MreC  38.65 
 
 		 357 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5094  rod shape-determining protein MreC  38.25 
 
 		 329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58130  rod shape-determining protein MreC  38.25 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.317249  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4471  rod shape-determining protein MreC  38.65 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.712319  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  37.21 
 
 		 362 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  40 
 
 		 254 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0934  rod shape-determining protein MreC  37.3 
 
 		 332 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0941  rod shape-determining protein MreC  37.75 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1938  rod shape-determining protein MreC  41.02 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000368183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0974  rod shape-determining protein MreC  37.35 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4281  rod shape-determining protein MreC  37.96 
 
 		 333 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.535486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  43.42 
 
 		 243 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  40.08 
 
 		 281 aa  189  5e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  38.52 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  38.35 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0513  rod shape-determining protein MreC  39.19 
 
 		 286 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  38.04 
 
 		 292 aa  176  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0514  rod shape-determining protein MreC  37.04 
 
 		 292 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000273535  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1647  rod shape-determining protein MreC  36.67 
 
 		 292 aa  172  7.999999999999999e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000765813  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  35.34 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0077  rod shape-determining protein MreC  34.36 
 
 		 324 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  38.11 
 
 		 407 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0170  rod shape-determining protein MreC  40.08 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0588  rod shape-determining protein MreC  36.94 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0508667  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0669  rod shape-determining protein MreC  36.19 
 
 		 316 aa  158  9e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.111553  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  34.94 
 
 		 336 aa  157  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0237  rod shape-determining protein MreC  36.15 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0874  rod shape-determining protein MreC  35.07 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0845  rod shape-determining protein MreC  35.07 
 
 		 302 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4399  rod shape-determining protein MreC  33.82 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0691605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3366  rod shape-determining protein MreC  33.71 
 
 		 348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0325  rod shape-determining protein MreC  33.09 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6462  rod shape-determining protein MreC  35.19 
 
 		 355 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0319  rod shape-determining protein MreC  35.71 
 
 		 298 aa  146  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04261  rod shape-determining protein MreC  36.89 
 
 		 448 aa  145  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410208  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0051  rod shape-determining protein MreC  33.09 
 
 		 367 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3689  rod shape-determining protein MreC  32.96 
 
 		 348 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3049  rod shape-determining protein MreC  34.44 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2497  rod shape-determining protein MreC  33.7 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.401568  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3166  rod shape-determining protein MreC  34.44 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0280823  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3111  rod shape-determining protein MreC  33.7 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417593  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0161  rod shape-determining protein MreC  34.44 
 
 		 357 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.749008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0365  rod shape-determining protein MreC  34.44 
 
 		 357 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0180  rod shape-determining protein MreC  34.44 
 
 		 357 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.841992  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3127  rod shape-determining protein MreC  33.7 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3108  rod shape-determining protein MreC  34.81 
 
 		 367 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.988939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2293  rod shape-determining protein MreC  34.44 
 
 		 357 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2786  rod shape-determining protein MreC  34.44 
 
 		 357 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>