More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0169 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  100 
 
 		 231 aa  476  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  93.94 
 
 		 231 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  79.9 
 
 		 233 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  69.18 
 
 		 208 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  67.08 
 
 		 212 aa  241  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  63.4 
 
 		 199 aa  218  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  57.8 
 
 		 193 aa  216  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  63.03 
 
 		 213 aa  215  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  56.73 
 
 		 189 aa  210  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  58.39 
 
 		 205 aa  209  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  58.02 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  62.82 
 
 		 195 aa  207  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  59.24 
 
 		 202 aa  205  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  59.87 
 
 		 185 aa  199  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  53.67 
 
 		 191 aa  190  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  48.24 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  47.51 
 
 		 184 aa  179  4e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 180 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  66.37 
 
 		 151 aa  169  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  64.06 
 
 		 195 aa  168  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  55.26 
 
 		 184 aa  167  9e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 184 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 184 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  57.66 
 
 		 192 aa  161  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  46.95 
 
 		 183 aa  159  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  44.79 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  44.19 
 
 		 179 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  50 
 
 		 199 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  44.19 
 
 		 230 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  46.25 
 
 		 179 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  44.19 
 
 		 230 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  47.83 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  47.2 
 
 		 183 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  54.93 
 
 		 195 aa  151  7e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  47.2 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  42.44 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  45.34 
 
 		 176 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  52.38 
 
 		 167 aa  148  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  43.67 
 
 		 158 aa  148  7e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  51.94 
 
 		 176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  39.18 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  51.16 
 
 		 176 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  43.5 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  43.45 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  47.93 
 
 		 182 aa  145  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  38.66 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  43.21 
 
 		 181 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  45.34 
 
 		 184 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  52.59 
 
 		 158 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  47.27 
 
 		 169 aa  144  1e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  43.75 
 
 		 181 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  41.97 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  52.21 
 
 		 160 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  47.13 
 
 		 158 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  38.14 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  47.74 
 
 		 158 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  40.36 
 
 		 177 aa  143  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  48.3 
 
 		 165 aa  141  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  47.86 
 
 		 162 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  48.65 
 
 		 182 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  47.02 
 
 		 170 aa  139  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  47.68 
 
 		 161 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  39.3 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  44.57 
 
 		 177 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 165 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1391  glutathione peroxidase  55.56 
 
 		 153 aa  138  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  40.12 
 
 		 190 aa  138  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 165 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  45.34 
 
 		 183 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  48.32 
 
 		 165 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  47.86 
 
 		 159 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  41.25 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  137  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  51.33 
 
 		 161 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15450  Glutathione peroxidase  48.32 
 
 		 158 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0674744  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  47.97 
 
 		 164 aa  136  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  47.18 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  47.65 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  48.41 
 
 		 158 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2679  glutathione peroxidase  38.07 
 
 		 194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  49.02 
 
 		 161 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  43.31 
 
 		 161 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  47.52 
 
 		 188 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  43.67 
 
 		 180 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  43.71 
 
 		 185 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  44.77 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  49.25 
 
 		 159 aa  135  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  43.83 
 
 		 182 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  43.31 
 
 		 160 aa  135  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0324  Glutathione peroxidase  46.5 
 
 		 165 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324106  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3929  glutathione peroxidase  47.59 
 
 		 188 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.592022 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  48.05 
 
 		 160 aa  134  8e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  47.33 
 
 		 164 aa  134  8e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  48.32 
 
 		 168 aa  134  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0316  glutathione peroxidase  47.52 
 
 		 184 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.282271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0360  glutathione peroxidase  47.52 
 
 		 184 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  38.17 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  49.25 
 
 		 159 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  49.25 
 
 		 159 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  46.94 
 
 		 164 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>