More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0360 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0360  glutathione peroxidase  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0316  glutathione peroxidase  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.282271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  90.96 
 
 		 188 aa  345  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3929  glutathione peroxidase  68.62 
 
 		 188 aa  249  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.592022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1782  glutathione peroxidase  66.49 
 
 		 193 aa  244  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5475  glutathione peroxidase  63.59 
 
 		 189 aa  224  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416682  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  52.41 
 
 		 191 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  47.67 
 
 		 195 aa  157  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  49.01 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  48.37 
 
 		 161 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  47.26 
 
 		 158 aa  142  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  49.65 
 
 		 233 aa  140  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  47.52 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  47.62 
 
 		 176 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  50.76 
 
 		 184 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  50.76 
 
 		 184 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  44.37 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  45.99 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  45.99 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  45.99 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  45.99 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  45.99 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  44.67 
 
 		 185 aa  135  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  45.99 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  45.99 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  45.99 
 
 		 159 aa  135  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  48.34 
 
 		 176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  42.7 
 
 		 205 aa  134  8e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  47.52 
 
 		 231 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  47.52 
 
 		 231 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  44.9 
 
 		 161 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  40.94 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1883  glutathione peroxidase  46.71 
 
 		 152 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1207  glutathione peroxidase  44.29 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.205921 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  44.12 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  44.9 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  48.44 
 
 		 195 aa  128  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  41.38 
 
 		 161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  41.38 
 
 		 165 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  45.93 
 
 		 208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 163 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  41.38 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  41.61 
 
 		 164 aa  127  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  43.62 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  46.97 
 
 		 184 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  43.71 
 
 		 168 aa  127  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2055  putative glutathione peroxidase  44 
 
 		 177 aa  127  9.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.265735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  34.48 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  47.79 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  46.21 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  40.82 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  41.38 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  44.85 
 
 		 158 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  40.27 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  47.06 
 
 		 164 aa  124  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  40.27 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  40.69 
 
 		 167 aa  124  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  41.38 
 
 		 165 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  42.96 
 
 		 212 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  39.16 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  43.75 
 
 		 162 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  39.6 
 
 		 159 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  42 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  43.17 
 
 		 195 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  39.31 
 
 		 159 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  39.31 
 
 		 159 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  39.31 
 
 		 159 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  45.32 
 
 		 199 aa  122  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  42.45 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  41.06 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  47.33 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  45.16 
 
 		 167 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  39.73 
 
 		 165 aa  121  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  44.2 
 
 		 199 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  38.46 
 
 		 160 aa  121  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  42.55 
 
 		 183 aa  121  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  41.13 
 
 		 161 aa  121  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  43.17 
 
 		 213 aa  120  8e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  43.18 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  40.88 
 
 		 163 aa  120  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  42.22 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  42.28 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  38.46 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  38.46 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  38.46 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  41.04 
 
 		 180 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  38.46 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  38.46 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  42.95 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  41.73 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  40 
 
 		 161 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  39.6 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  42.42 
 
 		 158 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2931  glutathione peroxidase  41.18 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.953337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  40.28 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3253  Peroxiredoxin  45.45 
 
 		 164 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350236  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  37.76 
 
 		 160 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  41.01 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  37.76 
 
 		 160 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  38.52 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>