More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2526 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  100 
 
 		 180 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  67.28 
 
 		 184 aa  237  8e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  55.97 
 
 		 212 aa  187  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  52.5 
 
 		 208 aa  180  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  50 
 
 		 184 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  50 
 
 		 184 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  46.37 
 
 		 186 aa  179  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  53.5 
 
 		 202 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  47.75 
 
 		 203 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  47.75 
 
 		 203 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  48.31 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  50.93 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  47.93 
 
 		 184 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  50 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  51.23 
 
 		 230 aa  174  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  51.23 
 
 		 230 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  50 
 
 		 179 aa  174  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  47.19 
 
 		 203 aa  173  9e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  47.34 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 202 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  50 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 183 aa  171  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  49.39 
 
 		 208 aa  171  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 231 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  51.27 
 
 		 213 aa  170  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 183 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  47.13 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  47.43 
 
 		 177 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  49.68 
 
 		 231 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  51.85 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  50.32 
 
 		 233 aa  168  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  46.15 
 
 		 176 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  44.44 
 
 		 185 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  50.97 
 
 		 195 aa  164  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 193 aa  164  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 183 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  45.3 
 
 		 181 aa  160  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  46.75 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  45.35 
 
 		 181 aa  159  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  44.97 
 
 		 192 aa  160  1e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  49.69 
 
 		 180 aa  157  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 185 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  41.48 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  43.12 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1391  glutathione peroxidase  52.14 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  47.83 
 
 		 195 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  47.97 
 
 		 185 aa  141  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  44.1 
 
 		 191 aa  140  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1427  GMP synthase-like  48.3 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  52.71 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  51.85 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  51.85 
 
 		 165 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0007  glutathione peroxidase  47.02 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  51.94 
 
 		 161 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  50.39 
 
 		 161 aa  136  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  50.35 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  51.11 
 
 		 165 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  50.35 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  46.62 
 
 		 161 aa  135  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  50.35 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  47.1 
 
 		 162 aa  134  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  48.06 
 
 		 161 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  48.06 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  48.87 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  48.87 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  48.87 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  48.87 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  48.87 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  48.87 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  48.87 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  48.84 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  48.87 
 
 		 159 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  51.94 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  46.81 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  46.04 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  48.15 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  49.61 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  41.13 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  41.43 
 
 		 176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  44.1 
 
 		 159 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  50 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  49.61 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  47.33 
 
 		 165 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  47.37 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  46.46 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1677  glutathione peroxidase  45.7 
 
 		 151 aa  127  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  48.84 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  50 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  48.84 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  48.84 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  48.06 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  48.06 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  48.06 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  43.15 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  46.92 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  46.88 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  46.56 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  44.37 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  48.06 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>