More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5475 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5475  glutathione peroxidase  100 
 
 		 189 aa  377  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416682  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1782  glutathione peroxidase  77.2 
 
 		 193 aa  296  8e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  64.02 
 
 		 188 aa  236  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3929  glutathione peroxidase  68.28 
 
 		 188 aa  230  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.592022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0316  glutathione peroxidase  62.5 
 
 		 184 aa  228  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.282271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0360  glutathione peroxidase  62.5 
 
 		 184 aa  228  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  53.72 
 
 		 191 aa  197  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  48.73 
 
 		 158 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  45.93 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  46.34 
 
 		 163 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  47.55 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  44.81 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  45.22 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  44.83 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  46.58 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  45.89 
 
 		 185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  44.83 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  46.58 
 
 		 161 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  44.89 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  44.14 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  44.14 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  44.14 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  44.14 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  44.14 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  44.14 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  44.14 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  44.76 
 
 		 159 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  45.27 
 
 		 159 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  45.27 
 
 		 159 aa  136  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  38.1 
 
 		 193 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  43.03 
 
 		 231 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  41.94 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  44.52 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  46.26 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  39.49 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  44.52 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  44.52 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  46.81 
 
 		 233 aa  134  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  42.42 
 
 		 231 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  48.15 
 
 		 185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1207  glutathione peroxidase  41.25 
 
 		 158 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.205921 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  41.45 
 
 		 158 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  42.14 
 
 		 162 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  44.76 
 
 		 162 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  45.71 
 
 		 199 aa  131  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  42.95 
 
 		 158 aa  131  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  41.45 
 
 		 161 aa  131  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2660  Glutathione peroxidase  44 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0609505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  49.23 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3106  glutathione peroxidase  43.31 
 
 		 167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422985  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  38.12 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  45.64 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  39.47 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  39.47 
 
 		 160 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  40.4 
 
 		 165 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  39.47 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  40.49 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  47.01 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5025  peroxiredoxin  45.89 
 
 		 171 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  39.47 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  39.47 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  38.82 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  39.47 
 
 		 160 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  44.97 
 
 		 170 aa  128  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  45.16 
 
 		 173 aa  128  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  39.47 
 
 		 160 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  40.88 
 
 		 158 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1883  glutathione peroxidase  45.21 
 
 		 152 aa  128  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  48.46 
 
 		 164 aa  128  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  40.68 
 
 		 182 aa  127  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  38.12 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  45 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  38.82 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  38.93 
 
 		 158 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  38.61 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  38.82 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3253  Peroxiredoxin  48.46 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  42.28 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  41.94 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  41.29 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  39.31 
 
 		 165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  43.26 
 
 		 168 aa  125  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  42.28 
 
 		 160 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0446  Glutathione peroxidase  39.38 
 
 		 157 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000054357  normal  0.0344695 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  44.14 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  42.14 
 
 		 161 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  43.62 
 
 		 160 aa  125  5e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  40 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  37.24 
 
 		 161 aa  124  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  41.43 
 
 		 161 aa  124  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  40.41 
 
 		 162 aa  124  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  39.26 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  45.77 
 
 		 191 aa  124  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  41.43 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2931  glutathione peroxidase  39.29 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.953337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>