More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3929 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3929  glutathione peroxidase  100 
 
 
188 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.592022 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  68.09 
 
 
188 aa  263  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0360  glutathione peroxidase  67.02 
 
 
184 aa  250  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0316  glutathione peroxidase  67.02 
 
 
184 aa  250  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.282271  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1782  glutathione peroxidase  65.45 
 
 
193 aa  239  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5475  glutathione peroxidase  68.28 
 
 
189 aa  236  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416682  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  53.76 
 
 
191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  48.88 
 
 
195 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  50.34 
 
 
185 aa  152  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  46.79 
 
 
158 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  47.68 
 
 
162 aa  144  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  45.51 
 
 
158 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  43.48 
 
 
205 aa  141  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  48.97 
 
 
233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  43.93 
 
 
231 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  36.67 
 
 
193 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  47.55 
 
 
195 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  47.59 
 
 
231 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  43.95 
 
 
161 aa  134  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  45.14 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  47.55 
 
 
213 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  44 
 
 
163 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  45.52 
 
 
161 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  44.83 
 
 
161 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  42.28 
 
 
159 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  42.28 
 
 
159 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  42.28 
 
 
159 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  42.28 
 
 
159 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  42.28 
 
 
159 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  42.28 
 
 
159 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  42.28 
 
 
159 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  42.28 
 
 
159 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  46.21 
 
 
164 aa  130  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  43.31 
 
 
159 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  43.31 
 
 
159 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  43.31 
 
 
159 aa  130  9e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  45.52 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  45.3 
 
 
176 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  42.68 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  42.68 
 
 
159 aa  129  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  42.68 
 
 
159 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  42.07 
 
 
208 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  46.67 
 
 
176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  41.78 
 
 
165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  46.85 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3253  Peroxiredoxin  48.89 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350236  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  45.52 
 
 
168 aa  126  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2055  putative glutathione peroxidase  43.93 
 
 
177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.265735 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  42.96 
 
 
161 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1390  glutathione peroxidase  40.56 
 
 
158 aa  125  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1364  glutathione peroxidase  40.56 
 
 
158 aa  125  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00178793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  43.95 
 
 
162 aa  124  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  35.83 
 
 
177 aa  125  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  41.5 
 
 
158 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  39.74 
 
 
158 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1207  glutathione peroxidase  41.45 
 
 
158 aa  124  8.000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.205921 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  42.57 
 
 
161 aa  124  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  42.57 
 
 
170 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  40.65 
 
 
167 aa  123  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  45.07 
 
 
208 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  41.78 
 
 
165 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  42.07 
 
 
212 aa  123  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  44.29 
 
 
161 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  41.78 
 
 
165 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  47.41 
 
 
164 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  42.96 
 
 
159 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  40.54 
 
 
161 aa  122  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  41.61 
 
 
198 aa  121  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  41.94 
 
 
161 aa  121  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  42.76 
 
 
173 aa  121  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  44.12 
 
 
180 aa  121  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  39.89 
 
 
185 aa  121  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  44.68 
 
 
191 aa  120  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  39.19 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  42.25 
 
 
159 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  39.19 
 
 
160 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  41.03 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  40.56 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  41.55 
 
 
158 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  39.07 
 
 
164 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  43.66 
 
 
189 aa  119  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5025  peroxiredoxin  42.66 
 
 
171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  41.29 
 
 
160 aa  118  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  38.51 
 
 
160 aa  118  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  43.57 
 
 
161 aa  118  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  38.51 
 
 
160 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  38.51 
 
 
160 aa  118  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  38.51 
 
 
160 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  41.73 
 
 
164 aa  118  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  40 
 
 
162 aa  118  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  38.51 
 
 
161 aa  117  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3106  glutathione peroxidase  42.75 
 
 
167 aa  117  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422985  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  38.36 
 
 
165 aa  117  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  42.65 
 
 
184 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  42.65 
 
 
184 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  38.51 
 
 
160 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  42.25 
 
 
158 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  38.51 
 
 
160 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  40.13 
 
 
161 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  40.69 
 
 
161 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>