More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2055 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2055  putative glutathione peroxidase  100 
 
 		 177 aa  362  2e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.265735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3273  glutathione peroxidase  52.32 
 
 		 174 aa  158  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  55.41 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1883  glutathione peroxidase  54.05 
 
 		 152 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  54.73 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  44 
 
 		 162 aa  138  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  47.14 
 
 		 233 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  46.43 
 
 		 231 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  45.99 
 
 		 199 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  44 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  45.45 
 
 		 183 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  45.75 
 
 		 195 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  44.57 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  45.71 
 
 		 231 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  47.76 
 
 		 184 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  47.76 
 
 		 184 aa  127  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  42.76 
 
 		 191 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  41.84 
 
 		 212 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0360  glutathione peroxidase  47.06 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  40.43 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0316  glutathione peroxidase  47.06 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.282271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3929  glutathione peroxidase  46.67 
 
 		 188 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.592022 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  42.11 
 
 		 184 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  42.36 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  40.94 
 
 		 182 aa  123  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  40.94 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  40.26 
 
 		 165 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  36.57 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  41.83 
 
 		 161 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  41.72 
 
 		 163 aa  121  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3447  glutathione peroxidase  38 
 
 		 161 aa  121  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  38.96 
 
 		 165 aa  120  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  36.67 
 
 		 161 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  40.79 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  44.03 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  42.11 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1782  glutathione peroxidase  40.33 
 
 		 193 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  43.14 
 
 		 164 aa  117  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  40.14 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  40 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  41.67 
 
 		 185 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1207  glutathione peroxidase  40 
 
 		 158 aa  117  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.205921 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  40.82 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5475  glutathione peroxidase  41.92 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416682  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  38.29 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  41.33 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  38.82 
 
 		 162 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  40.14 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  38.26 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  40 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  40.67 
 
 		 159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  40.67 
 
 		 159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  40.67 
 
 		 159 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  42.07 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  40.67 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  42.28 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  39.44 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  39.29 
 
 		 202 aa  114  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  41.78 
 
 		 161 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  38.64 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  40.6 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 162 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  39.71 
 
 		 161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  40.3 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  38.16 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  42 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00580  glutathione peroxidase, putative  37.58 
 
 		 185 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256439  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  39.33 
 
 		 158 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  41.22 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  39.33 
 
 		 159 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  36.88 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  38.16 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  41.61 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3995  Peroxiredoxin  39.6 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  45 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  40.91 
 
 		 163 aa  112  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  39.74 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  38.16 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  39.33 
 
 		 162 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  39.07 
 
 		 164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  36.57 
 
 		 186 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  40.67 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  41.33 
 
 		 168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  41.04 
 
 		 202 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3106  glutathione peroxidase  39.61 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422985  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1364  glutathione peroxidase  39.19 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00178793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  37.88 
 
 		 179 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  40.4 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1390  glutathione peroxidase  39.19 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  41.04 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  41.04 
 
 		 183 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06070  glutathione peroxidase  41.1 
 
 		 162 aa  111  6e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  39.87 
 
 		 179 aa  110  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  37.88 
 
 		 230 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5025  peroxiredoxin  41.91 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  37.24 
 
 		 160 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0956  glutathione peroxidase  40.71 
 
 		 168 aa  110  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  37.88 
 
 		 230 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>