More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2389 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2389  putative glutathione peroxidase  100 
 
 		 176 aa  358  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401751  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1053  glutathione peroxidase  98.3 
 
 		 176 aa  353  5e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.281088  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1883  glutathione peroxidase  83.44 
 
 		 152 aa  260  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3273  glutathione peroxidase  54.55 
 
 		 174 aa  162  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2055  putative glutathione peroxidase  55.41 
 
 		 177 aa  154  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.265735 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  50 
 
 		 195 aa  151  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  50.39 
 
 		 212 aa  148  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3880  putative glutathione peroxidase  51.41 
 
 		 191 aa  147  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.41902 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  50.39 
 
 		 208 aa  147  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  51.94 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  48.34 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  51.94 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  51.94 
 
 		 233 aa  144  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  51.16 
 
 		 199 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0392  glutathione peroxidase  46.47 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0773128  normal  0.361866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1782  glutathione peroxidase  48.63 
 
 		 193 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  47.65 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1762  glutathione peroxidase  48.46 
 
 		 183 aa  136  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.533866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  47.37 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  49.61 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0316  glutathione peroxidase  48.67 
 
 		 184 aa  134  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.282271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0360  glutathione peroxidase  48.67 
 
 		 184 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5475  glutathione peroxidase  46.26 
 
 		 189 aa  134  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416682  normal  0.0282506 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  48.06 
 
 		 208 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  48.89 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  48.89 
 
 		 184 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  48.84 
 
 		 189 aa  134  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  47.69 
 
 		 185 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  50 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  48.53 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  131  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  42.53 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  48.46 
 
 		 213 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  41.13 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  45.52 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  42.31 
 
 		 193 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  42.48 
 
 		 185 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  40.71 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  40.71 
 
 		 230 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  40.59 
 
 		 183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  40.71 
 
 		 179 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3929  glutathione peroxidase  46.67 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.592022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  40.71 
 
 		 230 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  40.43 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  40.43 
 
 		 203 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  40.43 
 
 		 203 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2853  glutathione peroxidase  41.13 
 
 		 177 aa  123  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.154923  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  38.18 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  37.09 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  40.8 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  42.36 
 
 		 186 aa  121  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  39.72 
 
 		 203 aa  121  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  43.41 
 
 		 184 aa  120  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  44.29 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1686  glutathione peroxidase  38.99 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.677668  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  42.77 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  38.99 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  40.14 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  41.95 
 
 		 205 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3349  glutathione peroxidase, putative  37.86 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  44.59 
 
 		 161 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  42.96 
 
 		 158 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  39.33 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  45.38 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  44.53 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  40.79 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  41.45 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  42.66 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  47.41 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  35.58 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  41.18 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  41.45 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  37.66 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  37.66 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  46.05 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  42.11 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  42.48 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  42.48 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  42.48 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  41.56 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  45.65 
 
 		 168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2679  glutathione peroxidase  40 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.241309  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  44.53 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  42.22 
 
 		 161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  37.66 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  43.79 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  42.22 
 
 		 161 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0359  glutathione peroxidase  40 
 
 		 182 aa  114  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  41.83 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  41.48 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  41.83 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2474  glutathione peroxidase, putative  39.01 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>