More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01222 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  100 
 
 		 185 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  71.6 
 
 		 192 aa  262  3e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  79.14 
 
 		 195 aa  245  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  53.41 
 
 		 205 aa  188  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  59.12 
 
 		 233 aa  185  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  54.12 
 
 		 231 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  54.49 
 
 		 199 aa  177  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  56.33 
 
 		 231 aa  177  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  56.41 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  56.05 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  56.08 
 
 		 199 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  58.39 
 
 		 202 aa  171  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  51.48 
 
 		 184 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  52.5 
 
 		 193 aa  168  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  51.59 
 
 		 184 aa  167  8e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  52.87 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  55.47 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  57.25 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  44.44 
 
 		 180 aa  165  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  54.35 
 
 		 158 aa  160  9e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  54.68 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  55.07 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  51.88 
 
 		 162 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  54.35 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  48.82 
 
 		 213 aa  158  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  52.23 
 
 		 161 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  50 
 
 		 162 aa  158  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  46.96 
 
 		 181 aa  158  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  55.8 
 
 		 160 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  55.8 
 
 		 160 aa  157  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  53.62 
 
 		 160 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  53.62 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  53.62 
 
 		 160 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  48.77 
 
 		 184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  46.63 
 
 		 177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  48.77 
 
 		 184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1391  glutathione peroxidase  55 
 
 		 153 aa  154  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 182 aa  154  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  50.32 
 
 		 181 aa  154  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  54.81 
 
 		 160 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  50 
 
 		 166 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  48.5 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  50.62 
 
 		 162 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  49.04 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  52.86 
 
 		 179 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  52.55 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  48.05 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  50 
 
 		 167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  50 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  48.1 
 
 		 182 aa  152  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  44.87 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  51.82 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1267  glutathione peroxidase  42.78 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0133013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  46.25 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  46.54 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  51.8 
 
 		 161 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  46.54 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  49.68 
 
 		 170 aa  148  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  45.91 
 
 		 183 aa  148  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  48.78 
 
 		 163 aa  148  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  46.54 
 
 		 183 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1197  glutathione peroxidase  42.22 
 
 		 203 aa  147  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00644229  normal  0.718028 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  45.91 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  45.91 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  45.91 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  46.54 
 
 		 183 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1196  glutathione peroxidase  42.22 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0218447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  48.73 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  45.28 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  52.08 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  45.91 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1348  glutathione peroxidase  43.26 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  45.12 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  51.08 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  53.79 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2515  glutathione peroxidase  47.27 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  51.32 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  44.65 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  44.65 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  44.65 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000573  glutathione peroxidase  40.45 
 
 		 181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  51.47 
 
 		 170 aa  145  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  52.48 
 
 		 161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  49.3 
 
 		 160 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  45.73 
 
 		 163 aa  144  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  46.88 
 
 		 163 aa  144  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  42.7 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  45 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  48.34 
 
 		 186 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  44.79 
 
 		 230 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  50.66 
 
 		 159 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  48.17 
 
 		 168 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  52.08 
 
 		 161 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  50.66 
 
 		 159 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  50.66 
 
 		 159 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  44.79 
 
 		 230 aa  144  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  44.79 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  45.28 
 
 		 183 aa  143  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  49.3 
 
 		 161 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05309  glutathione peroxidase  45.68 
 
 		 181 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>