More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1469 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  100 
 
 
183 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  100 
 
 
183 aa  384  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  98.91 
 
 
183 aa  380  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  99.45 
 
 
183 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  99.45 
 
 
183 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  87.43 
 
 
183 aa  343  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  87.43 
 
 
183 aa  342  2e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  87.43 
 
 
183 aa  342  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  86.89 
 
 
183 aa  340  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  85.79 
 
 
183 aa  340  8e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  85.79 
 
 
183 aa  338  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  85.79 
 
 
183 aa  338  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  85.79 
 
 
183 aa  338  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  86.89 
 
 
183 aa  338  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  86.34 
 
 
183 aa  337  4e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  61.75 
 
 
183 aa  244  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  60.44 
 
 
184 aa  237  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  60.44 
 
 
184 aa  237  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  60.44 
 
 
184 aa  237  8e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  60.11 
 
 
183 aa  236  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  58.47 
 
 
183 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  57.38 
 
 
183 aa  228  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  56.28 
 
 
183 aa  223  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  51.37 
 
 
182 aa  199  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  53.55 
 
 
181 aa  198  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  50.82 
 
 
182 aa  197  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  49.72 
 
 
204 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1348  glutathione peroxidase  49.19 
 
 
182 aa  186  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  48.65 
 
 
182 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  50.83 
 
 
182 aa  185  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  55.43 
 
 
169 aa  184  9e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  49.44 
 
 
173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  49.44 
 
 
162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  50.56 
 
 
162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  50.57 
 
 
177 aa  180  9.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  49.41 
 
 
160 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  47.22 
 
 
161 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  47.25 
 
 
166 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1914  glutathione peroxidase  47.54 
 
 
182 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  49.16 
 
 
163 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  48.91 
 
 
181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  48.82 
 
 
160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  47.75 
 
 
163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  51.48 
 
 
160 aa  177  7e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  48.3 
 
 
179 aa  176  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  47.16 
 
 
160 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  46.59 
 
 
160 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  46.82 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  49.42 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  46.86 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  49.44 
 
 
158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  50.93 
 
 
164 aa  171  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  49.11 
 
 
158 aa  171  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  45.05 
 
 
165 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  46.96 
 
 
164 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  52.12 
 
 
168 aa  171  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  47.8 
 
 
164 aa  171  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  45.05 
 
 
165 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  45.05 
 
 
165 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  44.44 
 
 
162 aa  170  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  47.65 
 
 
161 aa  169  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  46.93 
 
 
161 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  46.24 
 
 
160 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  48.24 
 
 
161 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  49.7 
 
 
158 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5485  glutathione peroxidase  49.69 
 
 
178 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219921  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  47.06 
 
 
161 aa  168  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  45.88 
 
 
160 aa  167  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  46.33 
 
 
162 aa  167  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  47.09 
 
 
160 aa  167  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  47.65 
 
 
161 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  49.1 
 
 
158 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  47.06 
 
 
161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  45.51 
 
 
165 aa  165  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  46.82 
 
 
178 aa  164  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  52.83 
 
 
182 aa  164  8e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  45.56 
 
 
161 aa  164  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  44.69 
 
 
165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  48.8 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  44.69 
 
 
163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  45.51 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  46.47 
 
 
161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  47.49 
 
 
167 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  44.91 
 
 
160 aa  161  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  45.51 
 
 
160 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  45.51 
 
 
160 aa  161  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  44.81 
 
 
165 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  46.02 
 
 
162 aa  161  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  44.81 
 
 
161 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  44.91 
 
 
160 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  44.81 
 
 
165 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  48.12 
 
 
164 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  44.75 
 
 
173 aa  159  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  45.88 
 
 
162 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  45.51 
 
 
160 aa  160  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  43.41 
 
 
167 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  44.91 
 
 
160 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  47.65 
 
 
161 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  44.91 
 
 
161 aa  159  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  47.59 
 
 
161 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>