More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2618 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  100 
 
 
195 aa  397  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  68.54 
 
 
185 aa  269  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  67.57 
 
 
192 aa  255  3e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1801  glutathione peroxidase  57.69 
 
 
199 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.740072  hitchhiker  0.00000253639 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1409  glutathione peroxidase  56.97 
 
 
184 aa  179  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0461  glutathione peroxidase  51.63 
 
 
191 aa  176  1e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  61.7 
 
 
231 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4667  glutathione peroxidase  60.29 
 
 
199 aa  175  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  58.86 
 
 
233 aa  175  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  50.28 
 
 
205 aa  175  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  61.7 
 
 
231 aa  174  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0018  glutathione peroxidase  55.77 
 
 
208 aa  174  7e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5165  Peroxiredoxin  57.25 
 
 
202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.648504  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0042  glutathione peroxidase  53.85 
 
 
212 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.490429  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  49.71 
 
 
193 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4103  putative glutathione peroxidase  51.53 
 
 
184 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02196  Glutathione peroxidase  53.64 
 
 
184 aa  169  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0197549  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  54.49 
 
 
204 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47550  putative glutathione peroxidase  51.53 
 
 
184 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.532704 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3912  glutathione peroxidase  56.2 
 
 
189 aa  168  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.295477  normal  0.0278841 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  54.09 
 
 
181 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  53.5 
 
 
181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  52.87 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  46.15 
 
 
182 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1348  glutathione peroxidase  45.65 
 
 
182 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1391  glutathione peroxidase  53.74 
 
 
153 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  54.3 
 
 
161 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  49.1 
 
 
183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0488  glutathione peroxidase  55.15 
 
 
185 aa  161  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.642227  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  54.35 
 
 
160 aa  161  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4659  glutathione peroxidase  47.62 
 
 
208 aa  161  7e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3670  glutathione peroxidase  48.65 
 
 
184 aa  160  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.174884  normal  0.0808268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3374  glutathione peroxidase  56.83 
 
 
195 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.479812  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  52.14 
 
 
158 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  54 
 
 
158 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3022  glutathione peroxidase  43.01 
 
 
230 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00278721  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  55.8 
 
 
160 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4024  glutathione peroxidase  56.83 
 
 
213 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  48.5 
 
 
183 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  48.5 
 
 
183 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  50.93 
 
 
182 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  48.5 
 
 
183 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  47.9 
 
 
183 aa  158  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  47.9 
 
 
183 aa  158  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  53.96 
 
 
160 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  47.9 
 
 
183 aa  158  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  47.31 
 
 
183 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  53.9 
 
 
182 aa  158  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  47.31 
 
 
183 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  47.9 
 
 
183 aa  158  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  53.37 
 
 
168 aa  157  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  53.12 
 
 
158 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  55.8 
 
 
160 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  53.64 
 
 
160 aa  157  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  53.96 
 
 
160 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3037  glutathione peroxidase  42.47 
 
 
230 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000026286  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  46.71 
 
 
183 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  46.99 
 
 
183 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1341  glutathione peroxidase  43.09 
 
 
179 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267656  hitchhiker  0.0000000425712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  53.52 
 
 
162 aa  156  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  51.08 
 
 
160 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  53.62 
 
 
160 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  49.68 
 
 
177 aa  156  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  42.93 
 
 
183 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1719  glutathione peroxidase family protein  45.95 
 
 
183 aa  155  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00731943  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  54.35 
 
 
167 aa  155  3e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  47.9 
 
 
183 aa  155  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  53.02 
 
 
158 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  53.42 
 
 
158 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  46.71 
 
 
183 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3180  glutathione peroxidase  44.51 
 
 
179 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000271589  normal  0.0170233 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  52.48 
 
 
162 aa  154  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2684  glutathione peroxidase  45.78 
 
 
179 aa  154  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.553323  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  50.7 
 
 
179 aa  154  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  51.28 
 
 
160 aa  153  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  46.96 
 
 
195 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  50 
 
 
182 aa  153  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  55.94 
 
 
161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  52.14 
 
 
166 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1284  glutathione peroxidase  46.15 
 
 
183 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.604655  normal  0.560913 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  49.69 
 
 
158 aa  151  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  48.8 
 
 
163 aa  151  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  42.93 
 
 
183 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2526  glutathione peroxidase  41.44 
 
 
180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.327392  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1654  glutathione peroxidase  45.56 
 
 
186 aa  151  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323621  hitchhiker  0.0047837 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  48.43 
 
 
182 aa  150  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  47.53 
 
 
184 aa  150  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  47.53 
 
 
184 aa  150  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  47.53 
 
 
184 aa  150  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1244  glutathione peroxidase  46.63 
 
 
176 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.300123 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0270  glutathione peroxidase  49.64 
 
 
158 aa  150  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  47.56 
 
 
161 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  54.55 
 
 
158 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  46.3 
 
 
162 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  44.83 
 
 
173 aa  150  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  49.07 
 
 
183 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  52.86 
 
 
158 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  46.99 
 
 
163 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4033  glutathione peroxidase  45.6 
 
 
183 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.475849  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  52 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>