More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2615 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  100 
 
 		 184 aa  383  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  100 
 
 		 184 aa  383  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  100 
 
 		 184 aa  383  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  69.23 
 
 		 183 aa  274  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  67.58 
 
 		 183 aa  267  8e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  64.29 
 
 		 183 aa  255  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  63.74 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  63.74 
 
 		 183 aa  246  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  62.09 
 
 		 183 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  60.44 
 
 		 183 aa  237  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  60.44 
 
 		 183 aa  237  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  60.22 
 
 		 183 aa  235  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  60.44 
 
 		 183 aa  234  4e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  60.44 
 
 		 183 aa  234  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  60.44 
 
 		 183 aa  234  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  60.44 
 
 		 183 aa  234  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  59.89 
 
 		 183 aa  233  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  59.34 
 
 		 183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  59.89 
 
 		 183 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  59.89 
 
 		 183 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  59.89 
 
 		 183 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  59.89 
 
 		 183 aa  231  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  59.34 
 
 		 183 aa  229  2e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  52.75 
 
 		 182 aa  200  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  57.07 
 
 		 181 aa  195  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  54.49 
 
 		 182 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 182 aa  193  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  51.93 
 
 		 177 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1914  glutathione peroxidase  50 
 
 		 182 aa  189  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  53.71 
 
 		 160 aa  187  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  49.17 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  53.71 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1348  glutathione peroxidase  50.82 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  50.27 
 
 		 182 aa  185  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  51.38 
 
 		 181 aa  184  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  52.57 
 
 		 160 aa  183  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  48.31 
 
 		 173 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  50.86 
 
 		 160 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  50.29 
 
 		 160 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  50.86 
 
 		 160 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  49.43 
 
 		 160 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  48.88 
 
 		 160 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  50 
 
 		 160 aa  174  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  51.43 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  46.93 
 
 		 170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  49.16 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  47.75 
 
 		 160 aa  170  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  48.02 
 
 		 163 aa  169  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  47.43 
 
 		 162 aa  167  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  48.02 
 
 		 162 aa  167  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  53.01 
 
 		 169 aa  167  7e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  45.36 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  49.7 
 
 		 165 aa  164  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  48.04 
 
 		 179 aa  164  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  47.46 
 
 		 162 aa  164  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  47.75 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  46.96 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  48.24 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  45.36 
 
 		 163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  48.24 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5485  glutathione peroxidase  44.38 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219921  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  47.59 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  48.48 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  47.65 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  46.67 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  46.47 
 
 		 165 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  48.04 
 
 		 167 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  46.47 
 
 		 165 aa  160  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  46.99 
 
 		 165 aa  161  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  47.88 
 
 		 165 aa  160  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  46.47 
 
 		 165 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  46.47 
 
 		 161 aa  160  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  47.27 
 
 		 165 aa  159  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0968  Glutathione peroxidase  48.21 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000061106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  46.33 
 
 		 163 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  46.39 
 
 		 158 aa  158  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  48.52 
 
 		 160 aa  157  7e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  47.59 
 
 		 162 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  47.02 
 
 		 158 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  49.7 
 
 		 168 aa  156  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  46.39 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1026  glutathione peroxidase  47.88 
 
 		 178 aa  156  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.04413  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  42.54 
 
 		 198 aa  155  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  46.15 
 
 		 162 aa  155  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  46.34 
 
 		 158 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1198  glutathione peroxidase  47.88 
 
 		 178 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00025984  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  46.67 
 
 		 164 aa  155  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  44.26 
 
 		 163 aa  154  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  45.3 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  47.59 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  46.06 
 
 		 165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  46.06 
 
 		 165 aa  154  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2662  glutathione peroxidase  47.27 
 
 		 181 aa  154  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0111206  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2759  glutathione peroxidase  45.2 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  45.18 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  41.53 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0137  glutathione peroxidase  43.72 
 
 		 169 aa  153  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  44.2 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  45.12 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>