More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1619 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  100 
 
 
164 aa  333  5e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  85.62 
 
 
165 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  83.12 
 
 
165 aa  271  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  83.12 
 
 
165 aa  271  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  83.12 
 
 
165 aa  271  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  71.88 
 
 
179 aa  238  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  70 
 
 
161 aa  226  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  68.75 
 
 
163 aa  222  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  64.74 
 
 
162 aa  214  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  65.84 
 
 
164 aa  209  9e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  61.94 
 
 
163 aa  208  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  60.38 
 
 
162 aa  206  8e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  60.62 
 
 
166 aa  201  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2759  glutathione peroxidase  60.78 
 
 
210 aa  200  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  61.11 
 
 
163 aa  198  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  58.28 
 
 
179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  58.13 
 
 
160 aa  191  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  56.13 
 
 
162 aa  187  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  55.48 
 
 
162 aa  184  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  55.9 
 
 
160 aa  185  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  55.28 
 
 
160 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  57.76 
 
 
161 aa  184  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  55.9 
 
 
160 aa  183  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  55.28 
 
 
160 aa  183  9e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3995  Peroxiredoxin  55.62 
 
 
164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  55.28 
 
 
160 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  56.25 
 
 
162 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  54.66 
 
 
160 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  54.66 
 
 
160 aa  178  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  54.9 
 
 
160 aa  177  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0671  glutathione peroxidase  56.1 
 
 
164 aa  176  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.131867  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  48.62 
 
 
183 aa  174  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  49.15 
 
 
183 aa  173  8e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  46.96 
 
 
183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  53.12 
 
 
161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  46.96 
 
 
183 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  46.96 
 
 
183 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  46.41 
 
 
183 aa  170  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1172  glutathione peroxidase family protein  56.25 
 
 
162 aa  170  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  48.07 
 
 
183 aa  169  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  46.15 
 
 
183 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  46.41 
 
 
183 aa  167  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  45.86 
 
 
183 aa  167  7e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  45.3 
 
 
183 aa  167  9e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  50.99 
 
 
161 aa  165  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  47.43 
 
 
183 aa  164  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2478  glutathione peroxidase  49.38 
 
 
164 aa  164  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.290642 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  45.76 
 
 
183 aa  164  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  47.43 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  47.43 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  47.43 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  47.43 
 
 
183 aa  163  9e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  45.76 
 
 
183 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  45.76 
 
 
183 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  53.46 
 
 
170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  50.85 
 
 
182 aa  162  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  48.77 
 
 
161 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  48.85 
 
 
204 aa  161  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  50.33 
 
 
161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  48.02 
 
 
182 aa  159  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  46.15 
 
 
173 aa  159  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  44.17 
 
 
161 aa  159  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  45.2 
 
 
183 aa  159  1e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  49.67 
 
 
161 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  48.77 
 
 
167 aa  158  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  54.29 
 
 
158 aa  157  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  48.34 
 
 
161 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  49.67 
 
 
161 aa  156  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  48.73 
 
 
198 aa  156  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  52.03 
 
 
168 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  51.7 
 
 
158 aa  155  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  48.98 
 
 
169 aa  155  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2171  glutathione peroxidase  49.33 
 
 
161 aa  153  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0779752 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  47.7 
 
 
182 aa  153  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  41.53 
 
 
184 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  41.53 
 
 
184 aa  152  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  41.53 
 
 
184 aa  152  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  46.3 
 
 
160 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  51.82 
 
 
165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  47.55 
 
 
165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1449  glutathione peroxidase  46.91 
 
 
162 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00937829  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  49.66 
 
 
160 aa  151  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1914  glutathione peroxidase  46.37 
 
 
182 aa  150  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  45.1 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1874  glutathione peroxidase  46.3 
 
 
162 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0631469  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  48.67 
 
 
173 aa  150  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  43.58 
 
 
182 aa  150  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  46.85 
 
 
165 aa  149  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  44.9 
 
 
170 aa  149  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1483  glutathione peroxidase  46.3 
 
 
162 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1348  glutathione peroxidase  44.13 
 
 
182 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  48.57 
 
 
158 aa  147  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3841  glutathione peroxidase  45.06 
 
 
162 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0688357  normal  0.342172 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  44.97 
 
 
177 aa  147  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  51.05 
 
 
158 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  47.13 
 
 
178 aa  146  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  47.02 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  47.45 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  51.43 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  47.02 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>