More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0671 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0671  glutathione peroxidase  100 
 
 
164 aa  341  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.131867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  59.01 
 
 
165 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  59.01 
 
 
165 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  59.01 
 
 
165 aa  189  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3995  Peroxiredoxin  55.9 
 
 
164 aa  188  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  56.1 
 
 
164 aa  176  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  55.56 
 
 
162 aa  175  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  55.9 
 
 
165 aa  175  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2478  glutathione peroxidase  55.63 
 
 
164 aa  173  8e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.290642 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  56.6 
 
 
163 aa  172  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  53.7 
 
 
162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  52.8 
 
 
162 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  52.47 
 
 
179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  50.93 
 
 
163 aa  162  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  51.55 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  53.12 
 
 
166 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  54.37 
 
 
161 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  53.12 
 
 
163 aa  157  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  53.12 
 
 
164 aa  157  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2759  glutathione peroxidase  48.77 
 
 
210 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  45.86 
 
 
170 aa  154  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  50 
 
 
162 aa  150  8e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  50.62 
 
 
165 aa  147  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2964  glutathione peroxidase  48.39 
 
 
160 aa  147  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  44.26 
 
 
183 aa  144  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  48.19 
 
 
163 aa  144  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  45.51 
 
 
204 aa  143  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  45.36 
 
 
183 aa  143  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  43.72 
 
 
183 aa  142  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  43.72 
 
 
183 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  43.72 
 
 
183 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  43.72 
 
 
183 aa  142  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  51.23 
 
 
158 aa  141  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  43.72 
 
 
183 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  47.56 
 
 
160 aa  141  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  44.1 
 
 
161 aa  141  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  43.72 
 
 
183 aa  142  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  43.72 
 
 
183 aa  142  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  46.3 
 
 
161 aa  141  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0324  Glutathione peroxidase  49.01 
 
 
165 aa  141  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324106  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  47.5 
 
 
160 aa  140  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  50 
 
 
161 aa  140  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  44.26 
 
 
183 aa  140  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  47.59 
 
 
157 aa  140  9e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  49.38 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  45.61 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2944  glutathione peroxidase  42.33 
 
 
195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0986023  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  45.68 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  46.95 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0446  Glutathione peroxidase  50.7 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000054357  normal  0.0344695 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  47.53 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  46.34 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  46.34 
 
 
161 aa  138  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  45.61 
 
 
183 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  45.61 
 
 
183 aa  138  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  45.61 
 
 
183 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  43.17 
 
 
183 aa  138  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  48.15 
 
 
158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  48.75 
 
 
160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  46.34 
 
 
161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  46.25 
 
 
160 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  46.25 
 
 
160 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  45.36 
 
 
183 aa  137  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  45.62 
 
 
158 aa  137  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  45.12 
 
 
161 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  46.88 
 
 
162 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  46.25 
 
 
160 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  47.53 
 
 
168 aa  136  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  47.8 
 
 
160 aa  135  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  45.03 
 
 
183 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  41.53 
 
 
183 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  44.74 
 
 
158 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  46.25 
 
 
160 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  46.25 
 
 
160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1449  glutathione peroxidase  48.39 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00937829  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  49.32 
 
 
158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  46.25 
 
 
160 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  48.75 
 
 
170 aa  135  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  44.74 
 
 
159 aa  134  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  46.41 
 
 
165 aa  134  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  46.34 
 
 
161 aa  134  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  43.17 
 
 
183 aa  134  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  46.88 
 
 
161 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  44.26 
 
 
183 aa  134  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  46.34 
 
 
161 aa  133  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  42.86 
 
 
182 aa  132  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  46.95 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  47.68 
 
 
169 aa  133  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  45.73 
 
 
161 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  46.71 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  45.12 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  43.9 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  42.31 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  43.04 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  44.3 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  46.75 
 
 
161 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  48.45 
 
 
164 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  42.58 
 
 
161 aa  131  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1874  glutathione peroxidase  46.45 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0631469  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  45.96 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>