More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3507 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  100 
 
 
204 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  59.22 
 
 
181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  60.56 
 
 
182 aa  209  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  56.59 
 
 
181 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  56.67 
 
 
182 aa  206  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  54.14 
 
 
183 aa  202  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  55.31 
 
 
182 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  56.73 
 
 
162 aa  199  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  54.71 
 
 
173 aa  198  3.9999999999999996e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  51.93 
 
 
183 aa  197  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  52.43 
 
 
183 aa  197  7.999999999999999e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1914  glutathione peroxidase  53.63 
 
 
182 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  53.59 
 
 
183 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  53.04 
 
 
183 aa  194  7e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  51.35 
 
 
183 aa  192  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  53.63 
 
 
182 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  53.8 
 
 
161 aa  191  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  53.8 
 
 
163 aa  191  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  53.8 
 
 
160 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  50 
 
 
183 aa  188  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1348  glutathione peroxidase  52.46 
 
 
182 aa  188  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  54.97 
 
 
162 aa  187  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  49.72 
 
 
183 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  49.17 
 
 
184 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  49.72 
 
 
183 aa  186  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  49.17 
 
 
184 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  49.17 
 
 
184 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  49.17 
 
 
183 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  50.28 
 
 
183 aa  185  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  50.28 
 
 
183 aa  185  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  50.28 
 
 
183 aa  185  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  51.46 
 
 
160 aa  185  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  53.22 
 
 
160 aa  184  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  49.72 
 
 
183 aa  184  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  49.17 
 
 
183 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  51.93 
 
 
177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  49.72 
 
 
183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  49.72 
 
 
183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  51.46 
 
 
160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  49.17 
 
 
183 aa  181  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  48.65 
 
 
183 aa  181  7e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  50.29 
 
 
160 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  49.17 
 
 
183 aa  179  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  50.29 
 
 
160 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  51.74 
 
 
179 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  53.85 
 
 
160 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  50.29 
 
 
160 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  52.05 
 
 
160 aa  178  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  50.29 
 
 
162 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  47.22 
 
 
167 aa  173  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  49.71 
 
 
161 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  50.62 
 
 
160 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  49.12 
 
 
162 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  51.43 
 
 
166 aa  169  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  49.14 
 
 
161 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  47.73 
 
 
163 aa  169  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  50 
 
 
160 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  50 
 
 
160 aa  168  5e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  47.16 
 
 
163 aa  167  7e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  51.79 
 
 
179 aa  167  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  45.71 
 
 
161 aa  167  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  49.38 
 
 
160 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  49.38 
 
 
161 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1172  glutathione peroxidase family protein  54.39 
 
 
162 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  50 
 
 
160 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  50 
 
 
160 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  48.75 
 
 
160 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  48.54 
 
 
158 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  48.75 
 
 
160 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  50.29 
 
 
162 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  45.14 
 
 
161 aa  165  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  48.84 
 
 
158 aa  165  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  45.93 
 
 
161 aa  165  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0091  glutathione peroxidase  49.43 
 
 
174 aa  164  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  46.55 
 
 
161 aa  164  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  48.12 
 
 
160 aa  164  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  48.26 
 
 
161 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  48.85 
 
 
164 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  45.4 
 
 
161 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  49.41 
 
 
165 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  49.41 
 
 
165 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  49.41 
 
 
165 aa  162  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  46.55 
 
 
160 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  48.85 
 
 
164 aa  161  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5485  glutathione peroxidase  48.31 
 
 
178 aa  161  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219921  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  47.5 
 
 
158 aa  161  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  48.84 
 
 
163 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  44.1 
 
 
165 aa  160  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  48.52 
 
 
168 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  49.04 
 
 
158 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  49.04 
 
 
159 aa  159  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  48.78 
 
 
169 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  43.27 
 
 
165 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  43.27 
 
 
165 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  54.48 
 
 
195 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  47.17 
 
 
164 aa  159  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  44.19 
 
 
161 aa  158  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  48.54 
 
 
163 aa  158  6e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  46.15 
 
 
158 aa  158  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  46.33 
 
 
178 aa  157  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>