More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0777 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  100 
 
 		 160 aa  327  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  98.12 
 
 		 160 aa  323  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  98.12 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  90.57 
 
 		 160 aa  297  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  88.12 
 
 		 160 aa  292  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  85 
 
 		 161 aa  284  4e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  81.76 
 
 		 160 aa  277  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  81.88 
 
 		 162 aa  275  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  81.13 
 
 		 160 aa  274  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  78.62 
 
 		 160 aa  265  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1172  glutathione peroxidase family protein  83.12 
 
 		 162 aa  260  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  57.23 
 
 		 162 aa  196  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  54.72 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  55.76 
 
 		 166 aa  187  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  54.72 
 
 		 163 aa  184  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  54.66 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  50.56 
 
 		 183 aa  180  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  56.52 
 
 		 179 aa  180  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  53.12 
 
 		 179 aa  180  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  55.28 
 
 		 160 aa  180  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  56.44 
 
 		 163 aa  180  8.000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  50.86 
 
 		 184 aa  179  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  50.86 
 
 		 184 aa  179  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  50.86 
 
 		 184 aa  179  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  54.66 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  52.76 
 
 		 162 aa  179  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  50.29 
 
 		 204 aa  179  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  47.78 
 
 		 183 aa  178  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  48.31 
 
 		 183 aa  177  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  54.37 
 
 		 165 aa  177  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  50.56 
 
 		 183 aa  176  9e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  52.8 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  55.28 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  55.28 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  55.28 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  48.55 
 
 		 183 aa  174  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  48.55 
 
 		 183 aa  174  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  48.55 
 
 		 183 aa  174  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 183 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 183 aa  174  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 183 aa  174  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  53.38 
 
 		 158 aa  174  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  47.98 
 
 		 183 aa  173  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  52.87 
 
 		 160 aa  173  7e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  46.86 
 
 		 183 aa  173  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  52.5 
 
 		 170 aa  172  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  53.12 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  54.78 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  48.82 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  48.04 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  48.82 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  48.82 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  48.82 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  49.72 
 
 		 182 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  54.42 
 
 		 169 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  52.56 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  47.34 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  51.57 
 
 		 158 aa  170  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  50.94 
 
 		 158 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  49.06 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2759  glutathione peroxidase  50.92 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  50 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  53.02 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 159 aa  168  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  53.7 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  47.4 
 
 		 183 aa  168  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  49.07 
 
 		 163 aa  168  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  52.98 
 
 		 158 aa  167  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  48.77 
 
 		 161 aa  167  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  46.93 
 
 		 182 aa  167  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  46.88 
 
 		 165 aa  166  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  50.97 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  50.62 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  52.32 
 
 		 158 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  51.25 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  48.73 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  48.73 
 
 		 160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  48.73 
 
 		 160 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 162 aa  164  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  47.75 
 
 		 183 aa  164  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  48.1 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  50.63 
 
 		 198 aa  164  5e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  50 
 
 		 157 aa  164  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  51.35 
 
 		 164 aa  164  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  48.73 
 
 		 160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  47.5 
 
 		 160 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  48.73 
 
 		 160 aa  163  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  48.73 
 
 		 160 aa  163  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  45.4 
 
 		 182 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  48.1 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  53.02 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  48.52 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  48.1 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  49.38 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  47.77 
 
 		 170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  49.44 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  51.85 
 
 		 164 aa  162  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  46.58 
 
 		 159 aa  161  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  48.85 
 
 		 182 aa  161  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>