More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4940 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  100 
 
 
165 aa  338  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  100 
 
 
165 aa  338  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  100 
 
 
165 aa  338  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  80 
 
 
165 aa  274  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  83.12 
 
 
164 aa  271  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  73.75 
 
 
163 aa  243  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  72.5 
 
 
179 aa  240  7e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  71.79 
 
 
161 aa  229  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  65.41 
 
 
162 aa  222  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  66.04 
 
 
162 aa  222  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  65 
 
 
163 aa  222  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  68.1 
 
 
164 aa  222  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  62.42 
 
 
166 aa  221  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2759  glutathione peroxidase  63.23 
 
 
210 aa  207  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  61.39 
 
 
163 aa  202  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  56.96 
 
 
179 aa  200  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  56.88 
 
 
162 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  56.69 
 
 
162 aa  191  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  57.69 
 
 
160 aa  191  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0671  glutathione peroxidase  59.01 
 
 
164 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.131867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  55.9 
 
 
160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  57.14 
 
 
160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  55.9 
 
 
160 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  57.14 
 
 
161 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  55.9 
 
 
160 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  55.28 
 
 
160 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3995  Peroxiredoxin  54.04 
 
 
164 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  55.28 
 
 
160 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  54.66 
 
 
160 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  54.14 
 
 
198 aa  174  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  55.83 
 
 
162 aa  174  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  47.49 
 
 
183 aa  174  5e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  55.7 
 
 
161 aa  174  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  54.66 
 
 
160 aa  174  7e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  55.06 
 
 
170 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  45.05 
 
 
183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  45.05 
 
 
183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  45.05 
 
 
183 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  45.05 
 
 
183 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  53.12 
 
 
158 aa  169  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  44.51 
 
 
183 aa  169  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  53.21 
 
 
167 aa  168  4e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  48.81 
 
 
173 aa  167  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  50 
 
 
165 aa  167  6e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  53.05 
 
 
168 aa  165  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1172  glutathione peroxidase family protein  57.14 
 
 
162 aa  164  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  45.11 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  45.11 
 
 
183 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.449589 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  45.11 
 
 
183 aa  163  9e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  45.11 
 
 
183 aa  163  9e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  45.11 
 
 
183 aa  163  9e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  48.3 
 
 
183 aa  163  9e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  51.9 
 
 
158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  47.16 
 
 
183 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  45.11 
 
 
183 aa  162  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  49.16 
 
 
182 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  49.66 
 
 
169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  49.41 
 
 
204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  45.11 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  45.11 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  50.94 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  50.62 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  51.22 
 
 
161 aa  160  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  47.47 
 
 
158 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  49.14 
 
 
182 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  44.02 
 
 
183 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  46.37 
 
 
183 aa  159  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  44.57 
 
 
183 aa  159  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  45.45 
 
 
183 aa  158  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  50.61 
 
 
161 aa  157  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  52.41 
 
 
160 aa  157  8e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  48.47 
 
 
161 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2478  glutathione peroxidase  47.27 
 
 
164 aa  156  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.290642 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  46.25 
 
 
165 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  50 
 
 
162 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  48.47 
 
 
161 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  49.36 
 
 
158 aa  154  4e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  49.06 
 
 
160 aa  154  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  49.34 
 
 
173 aa  154  4e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  45.62 
 
 
165 aa  154  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  46.94 
 
 
170 aa  154  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  49.06 
 
 
161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  48.43 
 
 
160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  48.72 
 
 
182 aa  154  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  48.43 
 
 
160 aa  153  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  48.43 
 
 
161 aa  153  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  47.43 
 
 
178 aa  152  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  48.43 
 
 
160 aa  153  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1483  glutathione peroxidase  49.09 
 
 
162 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  46.26 
 
 
161 aa  152  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  43.87 
 
 
161 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  50 
 
 
160 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  46.2 
 
 
158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  47.8 
 
 
160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  47.8 
 
 
160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  47.75 
 
 
182 aa  151  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2944  glutathione peroxidase  42.24 
 
 
195 aa  151  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0986023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  49.38 
 
 
161 aa  150  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  50 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  47.8 
 
 
160 aa  150  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>