More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2909 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  100 
 
 		 198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  56.49 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  52.83 
 
 		 162 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  52.5 
 
 		 162 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  54.14 
 
 		 165 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  54.14 
 
 		 165 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  54.14 
 
 		 165 aa  174  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  51.97 
 
 		 167 aa  173  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  54.04 
 
 		 161 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  52.5 
 
 		 161 aa  170  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  51.57 
 
 		 158 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 163 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  53.25 
 
 		 165 aa  168  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3253  Peroxiredoxin  52.2 
 
 		 164 aa  167  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  51.59 
 
 		 170 aa  166  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  50.93 
 
 		 164 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  48.78 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2759  glutathione peroxidase  50.63 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  50.31 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  47.5 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  52.07 
 
 		 165 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  50.96 
 
 		 161 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  48.08 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  52.74 
 
 		 160 aa  165  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 160 aa  165  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  52.83 
 
 		 162 aa  165  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  52.56 
 
 		 158 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  52.74 
 
 		 160 aa  165  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  52.74 
 
 		 160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  52.74 
 
 		 160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  52.23 
 
 		 164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  51.27 
 
 		 164 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  52.05 
 
 		 160 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  51.53 
 
 		 162 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  52.7 
 
 		 165 aa  164  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  50.63 
 
 		 160 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  52.74 
 
 		 160 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  52 
 
 		 164 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  50.96 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  50.63 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  52.05 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  52.74 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  52.74 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  52.74 
 
 		 160 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  51.9 
 
 		 168 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  49.38 
 
 		 162 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  50.93 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  52.32 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  50.31 
 
 		 158 aa  161  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  50.91 
 
 		 168 aa  161  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  50.62 
 
 		 165 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  50.97 
 
 		 160 aa  160  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  50.32 
 
 		 160 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  50.62 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  50 
 
 		 162 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  50.62 
 
 		 161 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  53.59 
 
 		 179 aa  160  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  50.97 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  49.35 
 
 		 163 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  53.29 
 
 		 161 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  49.38 
 
 		 169 aa  158  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 159 aa  158  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0091  glutathione peroxidase  51.27 
 
 		 174 aa  158  5e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  49.38 
 
 		 163 aa  158  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  47.47 
 
 		 160 aa  158  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  49.07 
 
 		 161 aa  158  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 161 aa  158  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 160 aa  158  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  48.45 
 
 		 161 aa  157  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  48.75 
 
 		 164 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  46.24 
 
 		 182 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  44.2 
 
 		 183 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  51.02 
 
 		 159 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  44.2 
 
 		 183 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  51.02 
 
 		 159 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  48.05 
 
 		 165 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  47.17 
 
 		 158 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  43.65 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  48.73 
 
 		 164 aa  156  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  44.69 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  43.96 
 
 		 183 aa  156  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  42.54 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  48.75 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  48.68 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  50.68 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  42.54 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  42.54 
 
 		 184 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  48.75 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  48.05 
 
 		 165 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  48.45 
 
 		 161 aa  155  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  46.3 
 
 		 164 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  52.63 
 
 		 161 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  43.65 
 
 		 183 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  48.75 
 
 		 161 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  51.63 
 
 		 161 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  51.35 
 
 		 159 aa  154  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  43.65 
 
 		 183 aa  154  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  47.8 
 
 		 161 aa  154  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  50 
 
 		 160 aa  154  8e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>