More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1059 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  100 
 
 		 178 aa  367  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5485  glutathione peroxidase  84.27 
 
 		 178 aa  319  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219921  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  53.93 
 
 		 165 aa  209  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  53.11 
 
 		 158 aa  194  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  53.14 
 
 		 161 aa  194  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  52.84 
 
 		 160 aa  194  7e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  51.43 
 
 		 164 aa  189  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  51.69 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  52.54 
 
 		 161 aa  188  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  52.27 
 
 		 162 aa  185  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  51.43 
 
 		 168 aa  185  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  50 
 
 		 158 aa  184  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  53.98 
 
 		 167 aa  184  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  50.29 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  48.59 
 
 		 158 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  49.43 
 
 		 165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  48.88 
 
 		 160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  51.14 
 
 		 162 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  49.43 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  50.57 
 
 		 162 aa  182  3e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  47.46 
 
 		 158 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3106  glutathione peroxidase  50.28 
 
 		 167 aa  182  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422985  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  47.46 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3447  glutathione peroxidase  49.71 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  48.85 
 
 		 165 aa  180  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  48.31 
 
 		 161 aa  179  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  47.75 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  48.31 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  48.31 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  47.75 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  47.75 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  50.57 
 
 		 165 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  45.76 
 
 		 161 aa  178  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  47.19 
 
 		 160 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  47.75 
 
 		 160 aa  177  7e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2176  glutathione peroxidase  52.53 
 
 		 143 aa  177  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0884553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  47.75 
 
 		 160 aa  177  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  49.43 
 
 		 160 aa  177  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  49.71 
 
 		 160 aa  177  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3253  Peroxiredoxin  48.86 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350236  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  49.43 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  50.57 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 161 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  48.59 
 
 		 168 aa  175  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  48.86 
 
 		 162 aa  175  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  47.46 
 
 		 169 aa  174  5e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3267  glutathione peroxidase  49.14 
 
 		 158 aa  174  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  48.59 
 
 		 164 aa  174  6e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  48.31 
 
 		 181 aa  174  7e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  46.33 
 
 		 161 aa  174  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  49.72 
 
 		 164 aa  173  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  48.02 
 
 		 163 aa  174  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  48.59 
 
 		 161 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  48.02 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  44.89 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0324  Glutathione peroxidase  49.15 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324106  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 159 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2679  Glutathione peroxidase  51.48 
 
 		 184 aa  172  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  48.59 
 
 		 161 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  45.51 
 
 		 159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  44.63 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  46.07 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2947  glutathione peroxidase  47.46 
 
 		 167 aa  171  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.781382  hitchhiker  0.0011995 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  46.33 
 
 		 160 aa  171  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 161 aa  171  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  48.02 
 
 		 164 aa  171  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 161 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  44.38 
 
 		 162 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  47.73 
 
 		 159 aa  171  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 159 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 158 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1874  glutathione peroxidase  48.19 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0631469  normal  0.307231 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  46.89 
 
 		 163 aa  170  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  45.2 
 
 		 158 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5025  peroxiredoxin  52.73 
 
 		 171 aa  170  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  48 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  48 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  48 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  48 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3198  Glutathione peroxidase protein  49.71 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  48 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2660  Glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0609505 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  48 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  48 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 158 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  45.09 
 
 		 161 aa  168  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  47.73 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 158 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  48.19 
 
 		 161 aa  168  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  47.22 
 
 		 162 aa  168  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1483  glutathione peroxidase  45.76 
 
 		 162 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  45.45 
 
 		 161 aa  168  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5332  glutathione peroxidase  49.4 
 
 		 163 aa  167  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0814545  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 159 aa  167  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1449  glutathione peroxidase  45.76 
 
 		 162 aa  167  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00937829  normal  0.354884 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  44.89 
 
 		 161 aa  167  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  45.29 
 
 		 161 aa  167  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  44.89 
 
 		 161 aa  167  7e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>