More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5485 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5485  glutathione peroxidase  100 
 
 		 178 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219921  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  84.27 
 
 		 178 aa  319  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  52.25 
 
 		 165 aa  207  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  52.25 
 
 		 160 aa  191  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  51.7 
 
 		 162 aa  191  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  51.98 
 
 		 158 aa  190  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  50.28 
 
 		 158 aa  189  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  51.69 
 
 		 160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  51.69 
 
 		 160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  51.69 
 
 		 161 aa  188  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  51.12 
 
 		 160 aa  188  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  51.41 
 
 		 160 aa  187  5e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  51.41 
 
 		 160 aa  187  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  50.28 
 
 		 158 aa  187  8e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  51.12 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  50.85 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  51.12 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  50.86 
 
 		 168 aa  185  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  50.29 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  50.57 
 
 		 162 aa  185  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  50 
 
 		 160 aa  185  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  51.48 
 
 		 164 aa  184  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  48.59 
 
 		 161 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  51.41 
 
 		 161 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  48.3 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  52.94 
 
 		 169 aa  182  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  50 
 
 		 160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  48.86 
 
 		 165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  48.3 
 
 		 161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  46.89 
 
 		 161 aa  181  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  50.89 
 
 		 162 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3253  Peroxiredoxin  49.43 
 
 		 164 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  50 
 
 		 158 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  50.28 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  50 
 
 		 162 aa  180  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  46.82 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3447  glutathione peroxidase  49.14 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  44.63 
 
 		 161 aa  179  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3106  glutathione peroxidase  50.29 
 
 		 167 aa  179  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422985  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  49.71 
 
 		 160 aa  177  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  49.72 
 
 		 165 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  48.57 
 
 		 164 aa  177  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  48.86 
 
 		 159 aa  177  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1597  glutathione peroxidase  52.54 
 
 		 159 aa  177  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00235323  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  48.59 
 
 		 164 aa  177  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  49.72 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  49.72 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  47.73 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20790  glutathione peroxidase  49.44 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  52.27 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  47.46 
 
 		 164 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  48.3 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  49.72 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  48.3 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 161 aa  176  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 161 aa  175  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  48.3 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5025  peroxiredoxin  52.12 
 
 		 171 aa  175  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0652457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  48.02 
 
 		 164 aa  175  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 161 aa  175  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  49.43 
 
 		 182 aa  175  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  48.3 
 
 		 165 aa  175  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2964  glutathione peroxidase  48.26 
 
 		 160 aa  174  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2660  Glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 159 aa  174  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0609505 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  46.63 
 
 		 159 aa  174  7e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2679  Glutathione peroxidase  51.74 
 
 		 184 aa  174  7e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  45.51 
 
 		 159 aa  174  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  45.76 
 
 		 160 aa  174  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  47.73 
 
 		 159 aa  174  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  50.54 
 
 		 182 aa  173  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  51.19 
 
 		 181 aa  174  9e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  46.02 
 
 		 162 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3267  glutathione peroxidase  49.14 
 
 		 158 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  52.76 
 
 		 183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  48.04 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  50.89 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  46.33 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  45.2 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 159 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  52.76 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 161 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  50 
 
 		 183 aa  171  3.9999999999999995e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  46.82 
 
 		 161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  46.02 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2176  glutathione peroxidase  48.73 
 
 		 143 aa  171  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0884553  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  52.76 
 
 		 183 aa  171  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  46.89 
 
 		 168 aa  170  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  52.15 
 
 		 183 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  52.15 
 
 		 183 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5332  glutathione peroxidase  49.41 
 
 		 163 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0814545  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 158 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  52.15 
 
 		 183 aa  170  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  45.45 
 
 		 161 aa  170  9e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  49.69 
 
 		 183 aa  170  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  52.15 
 
 		 183 aa  169  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  46.47 
 
 		 161 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  45.71 
 
 		 159 aa  169  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  52.15 
 
 		 183 aa  169  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  46.59 
 
 		 161 aa  170  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  45.45 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>