More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2674 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  100 
 
 
165 aa  340  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  91.46 
 
 
165 aa  316  7e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  90.24 
 
 
165 aa  313  7e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2798  glutathione peroxidase  74.69 
 
 
164 aa  261  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2934  glutathione peroxidase  73.29 
 
 
164 aa  256  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0465616  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  71.7 
 
 
159 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  71.7 
 
 
159 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  71.7 
 
 
159 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  71.7 
 
 
159 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  71.7 
 
 
159 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  71.7 
 
 
159 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  71.7 
 
 
159 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  71.07 
 
 
159 aa  251  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  70.44 
 
 
159 aa  243  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  69.81 
 
 
159 aa  241  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  68.55 
 
 
159 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  66.67 
 
 
159 aa  236  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  66.04 
 
 
159 aa  235  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  66.67 
 
 
159 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  66.67 
 
 
159 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  66.67 
 
 
159 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  66.04 
 
 
159 aa  233  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  67.72 
 
 
162 aa  232  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  64.02 
 
 
164 aa  231  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  67.31 
 
 
168 aa  230  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  64.38 
 
 
161 aa  224  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  63.98 
 
 
162 aa  224  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  65.19 
 
 
165 aa  223  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  66.04 
 
 
163 aa  223  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  63.12 
 
 
161 aa  223  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  65.82 
 
 
160 aa  221  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  62.5 
 
 
161 aa  221  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  62.5 
 
 
161 aa  221  4e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  63.92 
 
 
165 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  59.63 
 
 
164 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  63.12 
 
 
161 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  63.52 
 
 
163 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  63.46 
 
 
162 aa  216  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  62.89 
 
 
158 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  63.52 
 
 
158 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  61.01 
 
 
161 aa  210  7.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  62.66 
 
 
162 aa  209  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  58.97 
 
 
158 aa  208  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  60.51 
 
 
158 aa  208  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  58.33 
 
 
161 aa  208  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1897  glutathione peroxidase  61.01 
 
 
158 aa  207  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  60.9 
 
 
158 aa  206  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  60.76 
 
 
161 aa  206  8e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  60.26 
 
 
160 aa  206  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2699  glutathione peroxidase  62.26 
 
 
160 aa  206  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  60.76 
 
 
161 aa  206  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  60.76 
 
 
161 aa  206  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  62.89 
 
 
158 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  60.13 
 
 
161 aa  205  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  64.43 
 
 
164 aa  204  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  58.23 
 
 
160 aa  204  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  58.23 
 
 
160 aa  204  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  59.49 
 
 
162 aa  203  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  58.23 
 
 
160 aa  203  8e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  58.23 
 
 
165 aa  203  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  58.23 
 
 
160 aa  203  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  58.23 
 
 
160 aa  203  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  56.88 
 
 
161 aa  202  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  59.75 
 
 
160 aa  203  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  58.86 
 
 
161 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2006  glutathione peroxidase family protein  55.62 
 
 
160 aa  202  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  59.24 
 
 
161 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  58.86 
 
 
165 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  57.59 
 
 
160 aa  201  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3198  Glutathione peroxidase protein  60.78 
 
 
159 aa  201  3e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3267  glutathione peroxidase  59.75 
 
 
158 aa  201  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  56.33 
 
 
160 aa  201  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  58.86 
 
 
165 aa  201  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  60 
 
 
160 aa  201  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  56.33 
 
 
160 aa  201  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  56.33 
 
 
160 aa  201  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  59.12 
 
 
161 aa  201  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  60.62 
 
 
161 aa  201  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  57.32 
 
 
161 aa  201  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  60.62 
 
 
161 aa  201  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  58.86 
 
 
165 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  57.86 
 
 
158 aa  200  8e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  57.5 
 
 
160 aa  199  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3253  Peroxiredoxin  59.26 
 
 
164 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.350236  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  57.05 
 
 
161 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3053  peroxiredoxin  59.88 
 
 
164 aa  198  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.508134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3277  Peroxiredoxin  59.26 
 
 
164 aa  197  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  59.12 
 
 
168 aa  197  6e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  58.13 
 
 
161 aa  197  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  59.73 
 
 
161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  57.32 
 
 
165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  56.96 
 
 
161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  56.1 
 
 
167 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  56.6 
 
 
162 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2552  glutathione peroxidase  57.23 
 
 
161 aa  194  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.40006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  55.97 
 
 
182 aa  194  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  55.77 
 
 
161 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3106  glutathione peroxidase  56.52 
 
 
167 aa  194  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.422985  normal  0.284005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  57.32 
 
 
159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2964  glutathione peroxidase  56.33 
 
 
160 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>