More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_4022 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  100 
 
 
181 aa  370  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  68.72 
 
 
181 aa  266  8e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  65.56 
 
 
182 aa  242  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1914  glutathione peroxidase  62.22 
 
 
182 aa  240  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  57.22 
 
 
182 aa  228  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1348  glutathione peroxidase  57.22 
 
 
182 aa  227  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  58.56 
 
 
182 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  58.66 
 
 
177 aa  212  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  56.59 
 
 
204 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  55.19 
 
 
183 aa  205  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  55.49 
 
 
183 aa  199  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  53.55 
 
 
183 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  53.55 
 
 
183 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  53.55 
 
 
183 aa  198  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  53.01 
 
 
183 aa  197  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  56.28 
 
 
182 aa  196  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  53.3 
 
 
183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  52.46 
 
 
183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  52.75 
 
 
183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  57.07 
 
 
184 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  57.07 
 
 
184 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  57.07 
 
 
184 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  54.64 
 
 
183 aa  190  8e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  54.1 
 
 
183 aa  189  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  53.55 
 
 
183 aa  187  7e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  53.55 
 
 
183 aa  187  7e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  53.55 
 
 
183 aa  187  7e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  53.55 
 
 
183 aa  186  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  53.55 
 
 
183 aa  186  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  53.01 
 
 
183 aa  185  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  50.82 
 
 
183 aa  184  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  51.7 
 
 
160 aa  184  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  53.01 
 
 
183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  51.7 
 
 
160 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  51.7 
 
 
160 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  53.01 
 
 
183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  51.7 
 
 
160 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  52.57 
 
 
162 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  51.14 
 
 
161 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  51.14 
 
 
160 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  51.14 
 
 
160 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  50.57 
 
 
160 aa  181  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  50.57 
 
 
160 aa  180  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  50.83 
 
 
167 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  50 
 
 
160 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  51.96 
 
 
168 aa  176  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  49.72 
 
 
162 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  48.31 
 
 
178 aa  174  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  51.96 
 
 
173 aa  174  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5485  glutathione peroxidase  51.19 
 
 
178 aa  174  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219921  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  51.7 
 
 
160 aa  171  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  50 
 
 
166 aa  171  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  48.02 
 
 
164 aa  171  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  49.17 
 
 
163 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  48.78 
 
 
164 aa  169  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  50 
 
 
160 aa  169  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  51.27 
 
 
158 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  49.72 
 
 
161 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  49.16 
 
 
161 aa  169  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  51.14 
 
 
160 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  50.28 
 
 
161 aa  168  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  49.14 
 
 
165 aa  168  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  49.14 
 
 
165 aa  168  4e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  48.3 
 
 
173 aa  168  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  48.6 
 
 
161 aa  168  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  47.43 
 
 
158 aa  167  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  48 
 
 
158 aa  167  9e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  50 
 
 
161 aa  167  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  46.93 
 
 
161 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  46.93 
 
 
162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  46.86 
 
 
165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  48.35 
 
 
163 aa  164  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  46.86 
 
 
163 aa  164  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3447  glutathione peroxidase  49.38 
 
 
161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  50 
 
 
168 aa  163  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  48 
 
 
179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  46.86 
 
 
169 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  49.72 
 
 
161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  49.44 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  48.88 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  49.72 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  45.81 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  48.9 
 
 
161 aa  162  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1597  glutathione peroxidase  49.14 
 
 
159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00235323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  44.69 
 
 
161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  45.71 
 
 
161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  47.19 
 
 
161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  47.19 
 
 
160 aa  161  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  46.86 
 
 
160 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  48.88 
 
 
160 aa  160  7e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  46.37 
 
 
161 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1384  glutathione peroxidase  46.96 
 
 
165 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  45.25 
 
 
161 aa  159  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  46.37 
 
 
161 aa  160  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  46.33 
 
 
170 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  45.14 
 
 
162 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  46.24 
 
 
158 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  48.52 
 
 
165 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  48.31 
 
 
162 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  46.96 
 
 
165 aa  158  3e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>