More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1929 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  100 
 
 
183 aa  380  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  100 
 
 
183 aa  380  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  99.45 
 
 
183 aa  377  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  99.45 
 
 
183 aa  379  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  99.45 
 
 
183 aa  377  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  97.81 
 
 
183 aa  373  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  97.81 
 
 
183 aa  373  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  97.81 
 
 
183 aa  373  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  98.36 
 
 
183 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  87.43 
 
 
183 aa  342  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  87.43 
 
 
183 aa  342  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  86.89 
 
 
183 aa  339  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  86.89 
 
 
183 aa  339  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  86.34 
 
 
183 aa  338  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  84.15 
 
 
183 aa  325  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  62.84 
 
 
183 aa  241  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  59.02 
 
 
183 aa  234  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  60.44 
 
 
184 aa  234  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  60.44 
 
 
184 aa  234  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  60.44 
 
 
184 aa  234  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  59.56 
 
 
183 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  56.83 
 
 
183 aa  220  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  56.28 
 
 
183 aa  217  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  50.82 
 
 
182 aa  192  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  50.27 
 
 
182 aa  190  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  53.55 
 
 
181 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  49.73 
 
 
182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  52.6 
 
 
173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  49.72 
 
 
204 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1348  glutathione peroxidase  48.63 
 
 
182 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  47.22 
 
 
162 aa  179  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  51.11 
 
 
182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  47.7 
 
 
160 aa  177  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  52.6 
 
 
160 aa  177  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  48.55 
 
 
161 aa  175  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  50 
 
 
177 aa  175  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  48.24 
 
 
160 aa  175  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  54.44 
 
 
169 aa  174  5e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1914  glutathione peroxidase  48.09 
 
 
182 aa  174  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  47.28 
 
 
166 aa  173  9e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  47.75 
 
 
162 aa  173  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  50.28 
 
 
163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  48.82 
 
 
160 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  47.75 
 
 
163 aa  171  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  48.24 
 
 
160 aa  170  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  48.28 
 
 
179 aa  169  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5485  glutathione peroxidase  52.15 
 
 
178 aa  169  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219921  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  50.59 
 
 
158 aa  169  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  47.65 
 
 
160 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  45.4 
 
 
160 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  46.55 
 
 
160 aa  168  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  46.96 
 
 
181 aa  167  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  47.19 
 
 
162 aa  167  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  49.11 
 
 
158 aa  167  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  47.34 
 
 
160 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  53.12 
 
 
168 aa  166  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  47.49 
 
 
161 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  49.41 
 
 
160 aa  165  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  47.65 
 
 
161 aa  164  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  47.09 
 
 
165 aa  164  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  48.02 
 
 
179 aa  164  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  51.27 
 
 
182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  46.47 
 
 
161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  47.9 
 
 
158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  45.11 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  45.76 
 
 
164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  45.11 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  45.11 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  45.11 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  50.92 
 
 
178 aa  162  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  47.31 
 
 
158 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  44.05 
 
 
161 aa  162  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1318  Peroxiredoxin  48.6 
 
 
167 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  47.83 
 
 
164 aa  161  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  45.4 
 
 
162 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  43.41 
 
 
167 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  48.48 
 
 
158 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  47.93 
 
 
161 aa  160  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  48.8 
 
 
162 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  47.06 
 
 
162 aa  159  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  46.2 
 
 
173 aa  159  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  44.12 
 
 
161 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  45.05 
 
 
164 aa  159  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  46.47 
 
 
161 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1368  glutathione peroxidase  45.36 
 
 
165 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2975  Glutathione peroxidase  45.36 
 
 
161 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36322  normal  0.036622 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1026  glutathione peroxidase  50 
 
 
178 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.04413  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  45.29 
 
 
161 aa  159  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1407  glutathione peroxidase  45.36 
 
 
165 aa  158  4e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0308338  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  46.93 
 
 
159 aa  158  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  49.07 
 
 
161 aa  158  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  47.16 
 
 
162 aa  157  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  45.88 
 
 
160 aa  157  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  45.56 
 
 
161 aa  157  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1198  glutathione peroxidase  49.38 
 
 
178 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00025984  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  46.15 
 
 
161 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  45.56 
 
 
161 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  47.44 
 
 
164 aa  156  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  46.88 
 
 
163 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  45.09 
 
 
161 aa  156  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>