More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7246 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  100 
 
 
182 aa  373  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  66.1 
 
 
181 aa  252  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  65.56 
 
 
181 aa  242  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  62.57 
 
 
182 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1348  glutathione peroxidase  62.01 
 
 
182 aa  239  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1914  glutathione peroxidase  62.15 
 
 
182 aa  231  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  61.88 
 
 
182 aa  221  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  58.89 
 
 
182 aa  217  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  56.98 
 
 
183 aa  213  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  56.28 
 
 
183 aa  208  4e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  56.42 
 
 
183 aa  207  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  56.28 
 
 
183 aa  206  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  55.62 
 
 
177 aa  204  5e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  55.31 
 
 
204 aa  202  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  54.49 
 
 
184 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  54.49 
 
 
184 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  54.49 
 
 
184 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  52.49 
 
 
183 aa  194  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  51.96 
 
 
183 aa  189  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  53.98 
 
 
162 aa  186  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  50.83 
 
 
183 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  50.83 
 
 
183 aa  185  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  50.28 
 
 
183 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  50.28 
 
 
183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  50.28 
 
 
183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  51.11 
 
 
183 aa  180  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  51.11 
 
 
183 aa  179  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  51.11 
 
 
183 aa  179  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  51.11 
 
 
183 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  50.56 
 
 
183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  50.56 
 
 
183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  50.56 
 
 
183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  50.56 
 
 
183 aa  175  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  50 
 
 
183 aa  174  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  49.16 
 
 
160 aa  174  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  47.25 
 
 
173 aa  173  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  52.3 
 
 
160 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  48.6 
 
 
161 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  48.6 
 
 
160 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  45.81 
 
 
160 aa  169  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5485  glutathione peroxidase  51.63 
 
 
178 aa  168  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219921  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  47.73 
 
 
162 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  48.3 
 
 
167 aa  167  7e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  46.93 
 
 
160 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  47.88 
 
 
160 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  46.37 
 
 
160 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  47.88 
 
 
160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  47.88 
 
 
160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  47.88 
 
 
160 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  47.27 
 
 
161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  46.07 
 
 
160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  47.27 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  46.67 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  49.16 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  47.27 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  46.67 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  49.16 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  49.16 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  46.93 
 
 
163 aa  161  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  51.23 
 
 
161 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  46.74 
 
 
192 aa  161  5.0000000000000005e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  50.62 
 
 
161 aa  160  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  46.06 
 
 
160 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  45.56 
 
 
165 aa  160  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  50.28 
 
 
161 aa  160  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  45.86 
 
 
162 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  48.88 
 
 
179 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  50.28 
 
 
168 aa  159  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  50 
 
 
161 aa  159  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  47.59 
 
 
165 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  44.69 
 
 
160 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  46.93 
 
 
161 aa  158  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1059  glutathione peroxidase  50 
 
 
178 aa  157  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.428642  normal  0.565362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  47.27 
 
 
164 aa  157  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  47.59 
 
 
165 aa  157  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  45.25 
 
 
160 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  45.6 
 
 
164 aa  156  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  45 
 
 
166 aa  156  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  46.63 
 
 
159 aa  155  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  47.83 
 
 
158 aa  155  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  45.51 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  47.7 
 
 
164 aa  153  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  46.58 
 
 
158 aa  153  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  44.25 
 
 
179 aa  153  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  48.45 
 
 
169 aa  152  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01222  ABC transporter vitamin B12 uptake permease  49.04 
 
 
185 aa  152  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.039958  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  44.91 
 
 
159 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  47.59 
 
 
162 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  47.75 
 
 
161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  44.94 
 
 
159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  45.2 
 
 
160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  47.73 
 
 
161 aa  151  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  44.91 
 
 
159 aa  151  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  44.91 
 
 
159 aa  151  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  44.91 
 
 
159 aa  151  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  44.91 
 
 
159 aa  151  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  44.91 
 
 
159 aa  151  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  44.91 
 
 
159 aa  151  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  44.91 
 
 
159 aa  151  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  44.38 
 
 
159 aa  151  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>