More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0559 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  100 
 
 
161 aa  331  3e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  87.9 
 
 
170 aa  284  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  57.76 
 
 
161 aa  190  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  55.9 
 
 
160 aa  189  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  57.76 
 
 
162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  56.52 
 
 
163 aa  186  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  53.75 
 
 
160 aa  184  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  56.25 
 
 
160 aa  183  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  53.75 
 
 
160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  54.66 
 
 
160 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  53.46 
 
 
162 aa  181  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  54.66 
 
 
160 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  55 
 
 
160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  53.12 
 
 
160 aa  179  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  54.43 
 
 
159 aa  179  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  53.07 
 
 
182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  54.09 
 
 
162 aa  178  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  51.57 
 
 
162 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  49.07 
 
 
161 aa  176  9e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  51.12 
 
 
183 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  54.04 
 
 
179 aa  175  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  56.58 
 
 
161 aa  174  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  52.8 
 
 
166 aa  174  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  55.7 
 
 
165 aa  174  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  55.7 
 
 
165 aa  174  5e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  55.7 
 
 
165 aa  174  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  50.62 
 
 
165 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01902  probable glutathione peroxidase  55.1 
 
 
165 aa  173  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  52.8 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  47.22 
 
 
183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3995  Peroxiredoxin  55.9 
 
 
164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  48.04 
 
 
182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  53.12 
 
 
164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0872  glutathione peroxidase  48.75 
 
 
158 aa  171  5.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  53.09 
 
 
164 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  52.5 
 
 
198 aa  170  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  50 
 
 
165 aa  170  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  52.5 
 
 
161 aa  169  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  50.62 
 
 
159 aa  169  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  50 
 
 
159 aa  169  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  50 
 
 
159 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  48.88 
 
 
183 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1914  glutathione peroxidase  47.19 
 
 
182 aa  169  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  46.11 
 
 
184 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  46.11 
 
 
184 aa  169  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  46.11 
 
 
184 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  50 
 
 
159 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  50.93 
 
 
158 aa  168  3e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  50 
 
 
159 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  50.32 
 
 
158 aa  168  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  50.62 
 
 
159 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  50 
 
 
159 aa  168  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  50.62 
 
 
159 aa  167  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1172  glutathione peroxidase family protein  57.14 
 
 
162 aa  167  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  49.06 
 
 
163 aa  167  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  46.67 
 
 
183 aa  167  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  54.67 
 
 
160 aa  167  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  54.67 
 
 
160 aa  167  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  50 
 
 
159 aa  167  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  54.84 
 
 
165 aa  167  7e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  49.38 
 
 
159 aa  167  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  49.38 
 
 
159 aa  167  8e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  49.38 
 
 
159 aa  167  8e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  49.38 
 
 
159 aa  167  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  50.62 
 
 
160 aa  167  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  49.38 
 
 
159 aa  167  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  49.38 
 
 
159 aa  167  8e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  49.38 
 
 
159 aa  167  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  54 
 
 
160 aa  166  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  52.7 
 
 
165 aa  166  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  54.67 
 
 
160 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  54.67 
 
 
160 aa  166  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  54.67 
 
 
160 aa  166  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1364  glutathione peroxidase  52.38 
 
 
158 aa  166  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00178793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  54.67 
 
 
160 aa  166  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  52.7 
 
 
165 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  50 
 
 
158 aa  166  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1390  glutathione peroxidase  52.38 
 
 
158 aa  166  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  49.11 
 
 
173 aa  166  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  51.25 
 
 
161 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  54.42 
 
 
162 aa  166  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  48.15 
 
 
165 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  54.67 
 
 
160 aa  165  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  51.59 
 
 
161 aa  166  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  51.33 
 
 
169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  54 
 
 
161 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  52.17 
 
 
163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  54 
 
 
160 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  52.47 
 
 
164 aa  164  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  45.56 
 
 
183 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  50.68 
 
 
165 aa  164  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  45.56 
 
 
183 aa  164  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  48.26 
 
 
204 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  49.06 
 
 
158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  52.03 
 
 
160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  54.41 
 
 
182 aa  163  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  53.33 
 
 
161 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3470  glutathione peroxidase  52.35 
 
 
158 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  51.92 
 
 
162 aa  163  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1499  glutathione peroxidase  56.49 
 
 
157 aa  163  9e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.278578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>