More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1015 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  100 
 
 
162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  66.67 
 
 
162 aa  244  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  65.84 
 
 
163 aa  236  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  68.32 
 
 
162 aa  231  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  66.04 
 
 
166 aa  227  4e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  66.46 
 
 
163 aa  227  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  65.41 
 
 
165 aa  222  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  65.41 
 
 
165 aa  222  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  65.41 
 
 
165 aa  222  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  61.64 
 
 
179 aa  219  9e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  64.78 
 
 
179 aa  219  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2759  glutathione peroxidase  59.01 
 
 
210 aa  208  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  60.87 
 
 
161 aa  208  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  61.49 
 
 
162 aa  207  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  60.38 
 
 
164 aa  206  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  62.26 
 
 
164 aa  205  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  59.12 
 
 
165 aa  201  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  57.76 
 
 
163 aa  198  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  56.6 
 
 
161 aa  191  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  54.72 
 
 
160 aa  191  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  55.35 
 
 
160 aa  191  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  55.35 
 
 
160 aa  190  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  56.88 
 
 
158 aa  189  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  54.72 
 
 
160 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  56.25 
 
 
160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  54.72 
 
 
160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  54.72 
 
 
160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  54.72 
 
 
160 aa  187  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  54.66 
 
 
160 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  52.5 
 
 
165 aa  185  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  53.75 
 
 
169 aa  184  6e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  54.37 
 
 
168 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  55.28 
 
 
158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  50.56 
 
 
183 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  50.56 
 
 
183 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  50.56 
 
 
183 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  48.88 
 
 
183 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  53.46 
 
 
161 aa  181  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  50.94 
 
 
165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  51.97 
 
 
160 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  51.97 
 
 
160 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  53.42 
 
 
162 aa  180  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  50.31 
 
 
165 aa  180  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  51.97 
 
 
160 aa  180  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  51.97 
 
 
161 aa  179  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  51.97 
 
 
160 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  51.97 
 
 
160 aa  179  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  50 
 
 
158 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  50 
 
 
183 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  51.97 
 
 
160 aa  178  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  51.97 
 
 
160 aa  178  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  52.83 
 
 
198 aa  179  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  51.32 
 
 
160 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  52.8 
 
 
163 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  51.97 
 
 
160 aa  178  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  51.57 
 
 
161 aa  177  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  54.43 
 
 
170 aa  176  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  50.29 
 
 
204 aa  176  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  51.27 
 
 
167 aa  176  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  49.72 
 
 
181 aa  176  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  52.83 
 
 
160 aa  175  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3995  Peroxiredoxin  53.46 
 
 
164 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  50.94 
 
 
161 aa  174  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0671  glutathione peroxidase  55.56 
 
 
164 aa  175  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.131867  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  51.19 
 
 
173 aa  173  7e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  52.83 
 
 
161 aa  173  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  52.83 
 
 
161 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  48.75 
 
 
161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  50 
 
 
183 aa  172  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2931  glutathione peroxidase  51.57 
 
 
159 aa  171  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.953337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  50 
 
 
158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  52.2 
 
 
159 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  48.8 
 
 
173 aa  171  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  52.2 
 
 
159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  53.06 
 
 
159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  52.2 
 
 
160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1172  glutathione peroxidase family protein  54.72 
 
 
162 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  46.89 
 
 
183 aa  170  6.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  50.99 
 
 
164 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  50.31 
 
 
161 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  52.38 
 
 
159 aa  170  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  47.19 
 
 
183 aa  169  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  50.31 
 
 
161 aa  169  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  45.76 
 
 
183 aa  169  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  51.27 
 
 
161 aa  169  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  50.31 
 
 
162 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  47.73 
 
 
182 aa  169  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  49.69 
 
 
161 aa  168  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  49.69 
 
 
161 aa  169  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  47.19 
 
 
183 aa  168  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3447  glutathione peroxidase  48.1 
 
 
161 aa  168  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  48.02 
 
 
184 aa  167  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  47.19 
 
 
183 aa  168  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  47.19 
 
 
183 aa  167  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  47.19 
 
 
183 aa  167  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  47.19 
 
 
183 aa  167  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  48.02 
 
 
184 aa  167  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  48.45 
 
 
161 aa  168  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  48.02 
 
 
184 aa  167  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  49.69 
 
 
159 aa  167  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.213102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>