More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1199 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0565  glutathione peroxidase  58.79 
 
 		 182 aa  220  7e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  58.89 
 
 		 182 aa  217  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4022  Glutathione peroxidase  58.56 
 
 		 181 aa  215  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.350366 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1257  glutathione peroxidase  53.3 
 
 		 182 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2152  putative glutathione peroxidase  53.55 
 
 		 183 aa  209  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1348  glutathione peroxidase  52.2 
 
 		 182 aa  207  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  56.67 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1655  Peroxiredoxin  53.01 
 
 		 183 aa  205  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.401167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  56.67 
 
 		 181 aa  204  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2774  putative glutathione peroxidase  53.8 
 
 		 183 aa  202  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.956503  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1829  putative glutathione peroxidase  52.75 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1732  putative glutathione peroxidase  52.46 
 
 		 183 aa  199  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1721  putative glutathione peroxidase  52.75 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326937  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1914  glutathione peroxidase  55.74 
 
 		 182 aa  200  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2615  putative glutathione peroxidase  52.75 
 
 		 184 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1626  Peroxiredoxin  51.37 
 
 		 183 aa  198  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2004  putative glutathione peroxidase  50.82 
 
 		 183 aa  197  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1469  putative glutathione peroxidase  50.82 
 
 		 183 aa  197  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2468  putative glutathione peroxidase  52.72 
 
 		 183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1452  putative glutathione peroxidase  50.27 
 
 		 183 aa  196  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1832  putative glutathione peroxidase  50.27 
 
 		 183 aa  195  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1436  putative glutathione peroxidase  50.27 
 
 		 183 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0293827 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  51.12 
 
 		 173 aa  195  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1929  putative glutathione peroxidase  50.82 
 
 		 183 aa  192  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1480  putative glutathione peroxidase  50.82 
 
 		 183 aa  192  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.854221 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1790  putative glutathione peroxidase  50.82 
 
 		 183 aa  192  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.799217  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2428  putative glutathione peroxidase  50.27 
 
 		 183 aa  191  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.182778  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01679  predicted glutathione peroxidase  50.27 
 
 		 183 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0313558  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1932  Glutathione peroxidase  50.27 
 
 		 183 aa  190  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0263246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01668  hypothetical protein  50.27 
 
 		 183 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0174889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1914  putative glutathione peroxidase  50.27 
 
 		 183 aa  188  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1921  putative glutathione peroxidase  50.82 
 
 		 183 aa  188  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.449589 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  51.15 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  54.55 
 
 		 162 aa  185  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  51.38 
 
 		 167 aa  179  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  51.72 
 
 		 160 aa  174  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  50 
 
 		 160 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  52.02 
 
 		 160 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  49.72 
 
 		 160 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  48.04 
 
 		 161 aa  171  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  48.89 
 
 		 166 aa  171  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  49.4 
 
 		 158 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  50.28 
 
 		 160 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  49.72 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  51.16 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  50.29 
 
 		 162 aa  169  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  51.16 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  48.28 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  50 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6518  Peroxiredoxin  48.59 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  50.58 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  48.59 
 
 		 163 aa  168  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  51.16 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  51.16 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  51.16 
 
 		 160 aa  167  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  51.16 
 
 		 160 aa  168  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  51.16 
 
 		 160 aa  167  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  50.58 
 
 		 160 aa  167  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  50.58 
 
 		 161 aa  167  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  51.46 
 
 		 160 aa  167  9e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  50.29 
 
 		 161 aa  167  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  48.55 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  46.07 
 
 		 162 aa  164  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  47.16 
 
 		 160 aa  164  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  46.63 
 
 		 163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27520  putative glutathione peroxidase  45.56 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.78279  normal  0.0357307 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3981  glutathione peroxidase  46.67 
 
 		 161 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.890862  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  46.37 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1909  peroxiredoxin  46.11 
 
 		 161 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154084  normal  0.204796 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  45.18 
 
 		 164 aa  161  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2329  putative glutathione peroxidase  45.56 
 
 		 161 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.509466  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1172  glutathione peroxidase family protein  51.12 
 
 		 162 aa  160  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  49.71 
 
 		 168 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  49.14 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  49.14 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  49.14 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3613  glutathione peroxidase  45.56 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.374005  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1619  glutathione peroxidase  48.02 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  46.2 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  46.39 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1781  glutathione peroxidase family protein  46.67 
 
 		 161 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  47.88 
 
 		 164 aa  157  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  49.41 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1246  glutathione peroxidase  50.62 
 
 		 192 aa  157  6e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.281187  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  47.4 
 
 		 170 aa  157  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  48.08 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0091  glutathione peroxidase  46.41 
 
 		 174 aa  156  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  47.22 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30390  glutathione peroxidase  47.2 
 
 		 173 aa  154  6e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5485  glutathione peroxidase  45.51 
 
 		 178 aa  154  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.219921  normal  0.973287 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11881  glutathione peroxidase  46.11 
 
 		 159 aa  154  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.431432  normal  0.0622646 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  43.89 
 
 		 161 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3995  Peroxiredoxin  46.63 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.083987 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  49.06 
 
 		 159 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  44.69 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  45.09 
 
 		 170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  49.06 
 
 		 159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  45.56 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  49.06 
 
 		 159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>