More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0238 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  100 
 
 		 170 aa  350  7e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2944  glutathione peroxidase  68.15 
 
 		 195 aa  232  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0986023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  52.23 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  56.96 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  48.65 
 
 		 163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  47.13 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  48.65 
 
 		 163 aa  167  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  47.44 
 
 		 162 aa  167  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  48.98 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  48.63 
 
 		 158 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  48 
 
 		 166 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  49.06 
 
 		 162 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  47.97 
 
 		 161 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  44.23 
 
 		 163 aa  165  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  43.95 
 
 		 162 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0040  Peroxiredoxin  52.32 
 
 		 206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0496109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  45.51 
 
 		 162 aa  164  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  47.97 
 
 		 165 aa  164  5e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  50.33 
 
 		 160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3925  Glutathione peroxidase  50.68 
 
 		 165 aa  163  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5134  glutathione peroxidase  47.1 
 
 		 165 aa  164  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0872  glutathione peroxidase  51.35 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  48.41 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  49.67 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  48.41 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  47.13 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3973  Peroxiredoxin  50.68 
 
 		 165 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360978 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  49.67 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  48.41 
 
 		 159 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  49.67 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  47.77 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  50.33 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  46.36 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  46.5 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  47.77 
 
 		 160 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 160 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3198  Glutathione peroxidase protein  48.41 
 
 		 159 aa  162  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  47.77 
 
 		 158 aa  162  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  47.95 
 
 		 161 aa  161  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  49.67 
 
 		 160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  48.73 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  49.67 
 
 		 160 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0956  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 168 aa  160  6e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  49.67 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  47.13 
 
 		 182 aa  160  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2964  glutathione peroxidase  48.67 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  46.5 
 
 		 161 aa  160  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  44 
 
 		 181 aa  160  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  43.71 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  47.13 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4148  Glutathione peroxidase  50 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1075  glutathione peroxidase  45.03 
 
 		 168 aa  159  1e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.364498  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  47.47 
 
 		 159 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2875  glutathione peroxidase  47.97 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000745159  hitchhiker  0.0000749041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  47.26 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1771  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 161 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  46.5 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  49.67 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  44.94 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  46.45 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  49.67 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2773  glutathione peroxidase  47.97 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000478947  hitchhiker  0.00587193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2705  glutathione peroxidase  47.3 
 
 		 161 aa  158  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000249576  hitchhiker  0.0000800256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1563  glutathione peroxidase, putative  48.63 
 
 		 162 aa  157  5e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1300  glutathione peroxidase  48.3 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1080  glutathione peroxidase  47.65 
 
 		 164 aa  157  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000852506  normal  0.679739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  45.22 
 
 		 160 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  46.94 
 
 		 161 aa  157  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  48.7 
 
 		 169 aa  156  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3447  glutathione peroxidase  47.62 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  45.22 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  46 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2764  glutathione peroxidase  49.32 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0187221  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  52.9 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  44.16 
 
 		 158 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  46.75 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  50.34 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0697  Glutathione peroxidase  52.48 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  47.3 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  43.31 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2679  glutathione peroxidase  50.66 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0324  Glutathione peroxidase  46 
 
 		 165 aa  154  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.324106  normal  0.0807721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  45.64 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2454  Peroxiredoxin  47.33 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0184161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  41.18 
 
 		 204 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1872  glutathione peroxidase  48.63 
 
 		 159 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0683727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  46.94 
 
 		 165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  46.94 
 
 		 165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0671  glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.131867  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  46.94 
 
 		 165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  42.86 
 
 		 179 aa  154  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  46.26 
 
 		 168 aa  154  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78456  glutathione peroxidase  49.66 
 
 		 160 aa  154  7e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.437317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  46 
 
 		 161 aa  154  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1364  glutathione peroxidase  49.01 
 
 		 158 aa  154  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00178793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1390  glutathione peroxidase  49.01 
 
 		 158 aa  154  8e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  46.79 
 
 		 165 aa  153  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>