More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0876 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  100 
 
 		 177 aa  363  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2944  glutathione peroxidase  55.77 
 
 		 195 aa  178  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0986023  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  56.96 
 
 		 170 aa  177  4.999999999999999e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2187  glutathione peroxidase  50.32 
 
 		 170 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.836515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  48.1 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  47.13 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0040  Peroxiredoxin  49.68 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0496109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  47.47 
 
 		 160 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2453  glutathione peroxidase  48.39 
 
 		 158 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.70182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  48.43 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0883  glutathione peroxidase  47.47 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.961514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  46.2 
 
 		 161 aa  158  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0694  glutathione peroxidase  45.62 
 
 		 161 aa  158  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000130339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53420  glutathione peroxidase  46.84 
 
 		 160 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.31883  normal  0.0505345 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2679  glutathione peroxidase  47.74 
 
 		 194 aa  155  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  43.45 
 
 		 204 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  45.57 
 
 		 163 aa  155  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1579  glutathione peroxidase  48.41 
 
 		 164 aa  154  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0189646  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  46.15 
 
 		 161 aa  154  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0777  glutathione peroxidase, putative  45.57 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  45.22 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  44.87 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0802  peroxiredoxin  45.57 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.033017 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0816  glutathione peroxidase  44.94 
 
 		 160 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 159 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  49.32 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  47.13 
 
 		 165 aa  150  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1315  glutathione peroxidase  44.51 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  43.87 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  49.32 
 
 		 165 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0956  glutathione peroxidase  46.05 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 159 aa  150  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  40.51 
 
 		 162 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  46.5 
 
 		 165 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  46.31 
 
 		 165 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41100  Glutathione peroxidase  43.67 
 
 		 160 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  44.23 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1199  glutathione peroxidase  44.05 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3198  Glutathione peroxidase protein  48.97 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.246451  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1075  glutathione peroxidase  46.05 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.364498  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0020  glutathione peroxidase  48.65 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2660  Glutathione peroxidase  44.87 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0609505 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  44.9 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  45.22 
 
 		 159 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  46.26 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1863  glutathione peroxidase  46.15 
 
 		 195 aa  148  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4413  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  46.36 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0191  Glutathione peroxidase  42.31 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  45.95 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  45.22 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  40.76 
 
 		 162 aa  147  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  47.06 
 
 		 169 aa  147  7e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  44.94 
 
 		 159 aa  147  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0559  glutathione peroxidase  48.32 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  43.67 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  47.37 
 
 		 160 aa  147  8e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  45.33 
 
 		 164 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  46.71 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0173  glutathione peroxidase  41.67 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.790659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  46.05 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  41.61 
 
 		 166 aa  146  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2741  glutathione peroxidase  46.31 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000260986  hitchhiker  0.0000615291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  43.31 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  45.7 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 159 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  46.71 
 
 		 160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  46.71 
 
 		 160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3267  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0851  glutathione peroxidase  44.94 
 
 		 161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.425919  decreased coverage  0.00020946 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1354  glutathione peroxidase  46.26 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.525114 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  43.31 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  46.94 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  45.39 
 
 		 160 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  45.06 
 
 		 162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  44.25 
 
 		 182 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2472  Glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161656  decreased coverage  0.0000149935 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  46.05 
 
 		 160 aa  144  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  43.31 
 
 		 179 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00658  glutathione peroxidase  41.94 
 
 		 161 aa  144  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0965068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  46.05 
 
 		 160 aa  144  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  43.59 
 
 		 165 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  43.59 
 
 		 165 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  46.05 
 
 		 160 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  44.9 
 
 		 158 aa  144  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  43.59 
 
 		 165 aa  144  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  43.67 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2639  glutathione peroxidase  41.51 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.833403 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3665  glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3447  glutathione peroxidase  45.89 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0243575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  42.68 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>