More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2679 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2679  glutathione peroxidase  100 
 
 		 194 aa  397  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0040  Peroxiredoxin  73.54 
 
 		 206 aa  284  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0496109 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1579  glutathione peroxidase  55.77 
 
 		 164 aa  191  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0189646  normal  0.0451688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2944  glutathione peroxidase  48.66 
 
 		 195 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0986023  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2187  glutathione peroxidase  50.93 
 
 		 170 aa  160  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.836515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0876  Peroxiredoxin  47.74 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0238  Peroxiredoxin  50.66 
 
 		 170 aa  155  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3507  glutathione peroxidase  44.38 
 
 		 204 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.721934  normal  0.622585 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1570  Glutathione peroxidase  44.3 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6245  Glutathione peroxidase  45.86 
 
 		 163 aa  144  9e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479243  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0841  glutathione peroxidase  42 
 
 		 164 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0436995  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1334  Peroxiredoxin  47.1 
 
 		 169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0131674  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2597  Peroxiredoxin  41.61 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4117  Peroxiredoxin  46.26 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1015  Glutathione peroxidase  45.22 
 
 		 162 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0150707 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1090  glutathione peroxidase  44.74 
 
 		 160 aa  138  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2558  Peroxiredoxin  44.59 
 
 		 162 aa  138  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.177554  normal  0.095865 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3685  glutathione peroxidase  41.61 
 
 		 163 aa  138  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2683  Peroxiredoxin  43.92 
 
 		 160 aa  138  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3238  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 159 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400465  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1571  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 159 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.154895  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2599  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 159 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2510  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 159 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2074  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 159 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895406  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2454  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 159 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1346  glutathione peroxidase  42.57 
 
 		 159 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.909183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5382  Peroxiredoxin  44.52 
 
 		 179 aa  137  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.0000126467  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2011  glutathione peroxidase  41.89 
 
 		 159 aa  137  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0261647  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1812  Peroxiredoxin  41.4 
 
 		 162 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0226  Peroxiredoxin  39.74 
 
 		 163 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1965  glutathione peroxidase  42.38 
 
 		 160 aa  135  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0718131  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2131  glutathione peroxidase  43.05 
 
 		 160 aa  135  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2618  glutathione peroxidase  46.94 
 
 		 195 aa  134  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.137836  normal  0.142472 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0162  glutathione peroxidase  39.11 
 
 		 231 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.520461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0845  Peroxiredoxin  45.45 
 
 		 179 aa  134  8e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494379  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0297  glutathione peroxidase  42.41 
 
 		 161 aa  134  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0981226  normal  0.609333 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1926  glutathione peroxidase  43.05 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0169  glutathione peroxidase  42.17 
 
 		 231 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2054  glutathione peroxidase  42.28 
 
 		 159 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6042  glutathione peroxidase  42.28 
 
 		 159 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2035  glutathione peroxidase  42.28 
 
 		 159 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2271  glutathione peroxidase  41.72 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2202  glutathione peroxidase  41.72 
 
 		 161 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177431  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1950  glutathione peroxidase  41.72 
 
 		 160 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210596  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1936  glutathione peroxidase  41.61 
 
 		 159 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.634874 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3184  glutathione peroxidase  42.38 
 
 		 160 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2154  glutathione peroxidase  41.72 
 
 		 160 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1178  glutathione peroxidase  45.21 
 
 		 158 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.375161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0128  glutathione peroxidase  41.55 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.594559  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2674  putative glutathione peroxidase protein  43.24 
 
 		 165 aa  132  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.552039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2964  glutathione peroxidase  40.4 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1971  glutathione peroxidase  41.72 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.775227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2119  glutathione peroxidase  41.72 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2067  glutathione peroxidase  41.61 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0307  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  42.95 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03223  glutathione peroxidase  40.23 
 
 		 181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02660  glutathione peroxidase  41.67 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2461  glutathione peroxidase  44.17 
 
 		 177 aa  131  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5344  glutathione peroxidase  40.94 
 
 		 159 aa  131  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.213102 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0123  glutathione peroxidase  40 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0265  Peroxiredoxin  41.5 
 
 		 165 aa  131  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000231119  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3641  peroxiredoxin  40.91 
 
 		 161 aa  130  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2249  glutathione peroxidase  42.68 
 
 		 162 aa  130  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487328  normal  0.155268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0889  glutathione peroxidase  37.8 
 
 		 168 aa  130  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2910  Glutathione peroxidase  44.59 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1247  Glutathione peroxidase  41.56 
 
 		 163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148462  normal  0.0739839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0484  glutathione peroxidase  39.19 
 
 		 161 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14340  glutathione peroxidase  40.99 
 
 		 166 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2504  Glutathione peroxidase  43.92 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.718008 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0118  glutathione peroxidase  39.74 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0872  glutathione peroxidase  41.22 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00580  glutathione peroxidase, putative  43.59 
 
 		 185 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256439  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1665  glutathione peroxidase  40.14 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0389024 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0237  putative glutathione peroxidase transmembrane protein  40.74 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1242  glutathione peroxidase  40.94 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2756  glutathione peroxidase  42.28 
 
 		 158 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  hitchhiker  0.0000941143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4940  glutathione peroxidase  43.59 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1390  glutathione peroxidase  40.79 
 
 		 158 aa  129  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1364  glutathione peroxidase  40.79 
 
 		 158 aa  129  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00178793  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3298  glutathione peroxidase  39.07 
 
 		 161 aa  129  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.40101  decreased coverage  0.0000000224321 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4557  glutathione peroxidase  43.59 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0904  glutathione peroxidase  39.33 
 
 		 158 aa  129  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000826936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4645  glutathione peroxidase  43.59 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2909  Peroxiredoxin  38.58 
 
 		 198 aa  128  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3617  Peroxiredoxin  44.83 
 
 		 163 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.78044  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1970  glutathione peroxidase  45 
 
 		 193 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0137  glutathione peroxidase  41.67 
 
 		 162 aa  127  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167473  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02770  glutathione peroxidase  41.5 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.359164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0250  glutathione peroxidase  38.51 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7246  glutathione peroxidase  38.15 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1214  glutathione peroxidase  42.47 
 
 		 167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4894  Peroxiredoxin  41.67 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0867  glutathione peroxidase  39.33 
 
 		 159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000118287  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4682  glutathione peroxidase  39.74 
 
 		 160 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4077  glutathione peroxidase  41.5 
 
 		 162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1010  glutathione peroxidase  40.26 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1769  glutathione peroxidase  39.33 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0182367  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0190  glutathione peroxidase  38.61 
 
 		 161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.926255  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1201  Glutathione peroxidase  43.87 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0952342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6295  glutathione peroxidase  40.82 
 
 		 162 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>